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申请/专利权人:中科(广州)生命科学研究有限公司
摘要:本发明提供一种孕妇游离DNA检测亲缘关系的方法和试剂盒,其特征在于,利用如SEQIDNO:9所示的抗cfDNA‑核小体复合体表面H2A抗原的纳米抗体偶联的磁珠悬液和羧基修饰的超顺磁性纳米微球悬液实现cfDNA的高浓度、高纯度提取,然后以提取的cfDNA进行高通量测序,选择与三联体和二联体CPI相关的检测基因进行不同亲缘关系类型进行分析,该方法在亲缘关系鉴定中的具有较高的应用效能。
主权项:1.一种孕妇游离DNA检测亲缘关系的方法,其特征在于,所述方法包括如下步骤:S1向待处理孕妇血浆样本内加入裂解结合液、蛋白酶K和磁珠悬液,颠倒混匀后,室温裂解结束后将反应管置于磁力架,静置离心,弃去残余液体,其中磁珠悬液为如SEQIDNO:9所示NH-5纳米抗体偶联的磁珠悬液;S2向离心管内加入洗涤液,涡旋混匀,离心管放置在磁力架上,待磁珠完全聚集后,吸出上清液;重复步骤S2三次,静置离心;S3向步骤S2的离心管内加入洗脱液,涡旋混匀,恒温孵育;S4将步骤S3的离心管置于磁力架上,待磁珠完全聚合后,吸出上清液;S5向步骤S4上清液中再次加入裂解结合液、蛋白酶K和羧基修饰的超顺磁性纳米微球悬液,颠倒混匀后,室温裂解结束后将反应管置于磁力架,静置离心,弃去残余液体,重复步骤S2-S4,得到cfDNA提取液;S6对S5步骤提取的cfDNA进行高通量测序,测序选择与三联体和二联体CPI相关的检测基因,即选自D3S1358、D8S1179、D21S11、D18S51、D5S818、D7S820和D13S317的STR标记基因、选自DYS19、DYS385、DYS389和DYS390的Y染色体STR标记、选自DXS8378、DXS7132、DXS7423和DXS101的X染色体STR标记以及选自rs1800497、rs1805007和rs3827760的补充标记SNP,对测序的结果利用Familias软件对不同亲缘关系类型进行分析,计算三联体和二联体CPI亲缘关系指数评估假设父亲的亲子概率。
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