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申请/专利权人：大连医科大学

摘要：本发明公开一种基于PageRank算法、MCC算法和网络药理学分析济生肾气丸治疗糖尿病肾病的核心活性成分和作用机理的方法，其通过筛选济生肾气丸活性成分及作用靶点、获取糖尿病肾病相关靶点、构建蛋白质相互作用PPI网络、GO功能及KEGG通路富集分析、筛选PPI网络中的核心药物靶点等步骤，确定济生肾气丸治疗糖尿病肾病的核心靶点及核心活性成分，并对济生肾气丸治疗糖尿病肾病的作用机制进行研究。本发明为济生肾气丸治疗糖尿病肾病的临床应用提供了科学的理论基础，同时为糖尿病肾病的临床治疗和科学研究提供了有效的方法，也为中西医结合治疗糖尿病肾病提供了新的理论依据。

主权项：1.一种基于PageRank算法、MCC算法和网络药理学分析济生肾气丸治疗糖尿病肾病的核心活性成分和作用机理的方法，其特征在于，其包括如下步骤：S1：筛选济生肾气丸活性成分及作用靶点：在中药分子机制生物信息学分析工具中检索济生肾气丸全方中熟地黄、附子、肉桂、山药、山茱萸、车前草、川牛膝、牡丹皮、茯苓和泽泻的化学成分并进行活性成分筛选，获得济生肾气丸各味药物活性成分信息，并收集活性成分的作用靶点；S2：获取糖尿病肾病相关靶点：在DrugBank、DisGeNET、GeneCards、OMIM和TTD数据库中检索糖尿病肾病相关靶点并保存；S3：获取药物-疾病交集靶点：利用Venny2.1网站，将获得的药物活性成分靶点与疾病相关靶点进行匹配，得到两者的交集靶点，并构建Venn图；S4：构建蛋白质相互作用网络：将上述药物-疾病交集靶点输入到STRING数据库中，构建药物-疾病交集靶点的蛋白质相互作用PPI网络，得到PPI网络图，并保存tsv文件以做进一步分析；S5：构建“药物-成分-靶点”网络：根据PPI网络中的靶点确定济生肾气丸治疗糖尿病肾病的活性成分，并通过Cytoscape3.9.1软件构建“药物-成分-靶点”网络，将药物、活性成分、作用靶点的关系可视化，得到“药物-成分-靶点”网络图；S6：GO功能及KEGG通路富集分析：基于生物学信息注释数据库，对PPI网络中的靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析；S7：筛选PPI网络中的核心靶点：首先，应用PageRank算法对PPI网络中的药物靶点进行打分，并取排名前20的药物靶点。其次，将STRING数据库导出的tsv文件导入到Cytoscape3.9.1软件中，然后应用cytoHubba插件，通过MCC算法进行排序整理，从PPI网络中筛选排名前20的药物靶点。最后，取两种算法所发现的核心靶点的交集，即为济生肾气丸治疗糖尿病肾病的核心靶点；S8：确定济生肾气丸治疗糖尿病肾病的核心活性成分：通过步骤S6所得济生肾气丸治疗糖尿病肾病的核心靶点，来确定济生肾气丸治疗糖尿病肾病的的核心活性成分。

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