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基于BPMLP-XGBoost的产品活性值和ADMET性质的预测方法及系统 

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申请/专利权人:中国工程物理研究院计算机应用研究所;电子科技大学

摘要:本发明公开了一种基于BPMLP‑XGBoost的药物产品活性值和ADMET性质的预测方法及系统,属于生物医药与计算科学交叉技术领域,解决现有技术对药物产品的生物活性值和ADMET性质的预测准确率低的问题。本发明对输入的所有药物数据进行预处理,其中,药物数据为分子描述符数据;对预处理得到的药物数据进行特征提取,提取后训练生物活性值预测模型,得到训练好的生物活性值预测模型;基于预处理得到的药物产品数据训练ADMET性质预测模型,得到训练好的ADMET性质预测模型;基于训练后得到的生物活性值预测模型和ADMET性质预测模型对待筛选的药物产品数据的生物活性值和ADMET性质进行预测,根据预测结果以及筛选条件,对药物产品数据清单进行筛选,得到候选药物产品数据筛选清单。本发明用于药物产品筛选,也可间接将方法用于如元器件等之类的其他产品筛选。

主权项:1.一种基于BPMLP-XGBoost的产品活性值和ADMET性质的预测方法,其特征在于,包括如下步骤:步骤1、对输入的所有药物产品数据进行预处理,其中,药物产品数据为分子描述符;步骤2、对预处理得到的药物产品数据进行特征提取,提取后训练产品生物活性值预测模型,得到训练好的产品生物活性值预测模型;步骤3、基于预处理得到的药物产品数据训练ADMET性质预测模型,得到训练好的ADMET性质预测模型;步骤4、基于训练后得到的产品生物活性值预测结果、ADMET性质预测结果以及设置的筛选条件,对待筛选的药物清单进行数据筛选,得到候选药物产品筛选清单数据;所述步骤2中的生物活性值预测模型为基于反向传播优化的多层感知机BPMLP模型,即采用Adam优化器在MLP的基础上加入误差反向传播优化;所述步骤2的具体步骤为:步骤21、基于预处理后的药物数据训练分子描述符数据提取器LGBM;步骤22、基于训练后的分子描述符数据提取器LGBM返回的特征重要性与生物活性值相关性较高的前20个分子描述符;步骤23、将得到的前20个分子描述符数据训练生物活性值预测模型,得到训练好的生物活性值预测模型;所述步骤3中的ADMET性质预测模型为XGBoost模型;所述步骤4的具体步骤为:步骤41、基于训练好的生物活性值预测模型,对待筛选的药物产品数据清单中的药物数据进行预测,得到预测结果A;步骤42、基于训练好的生物活性值预测模型,对待筛选的药物产品数据清单中的药物数据进行预测,得到预测结果B;步骤43、设置生物活性值及ADMET性质的筛选条件;步骤44、预测结果A与生物活性值筛选条件进行比较,筛选出符合筛选条件的药物产品数据,保存符合筛选条件的药物产品数据;步骤45将预测结果B与ADMET性质筛选条件进行比较,筛选出符合筛选条件的药物数据,保存符合筛选条件的药物产品数据;步骤46.取步骤44得到的筛选结果与步骤45得到的筛选结果的交集,得到候选药物产品筛选清单。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 中国工程物理研究院计算机应用研究所 电子科技大学 基于BPMLP-XGBoost的产品活性值和ADMET性质的预测方法及系统

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