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基于核酸纳米框架空间三维芯片的自定义长单链DNA的制备方法与信息存储的应用 

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申请/专利权人:上海交通大学医学院附属仁济医院

摘要:本发明公开了一种基于核酸纳米框架空间三维芯片的自定义长单链DNA的制备方法与信息存储的应用。本发明以一种DNA框架纳米结构作为三维空间芯片,利用芯片内精确的空间位点定义彼此连接的序列顺序,通过设计桥接链将2‑30条任意序列的寡核苷酸依序连接并通过酶促连接获得完整的环状单链DNA,实现自定义单链的制备。本发明还提供了信息在三维空间内的存储读取与信息库的构建与随机访问。对于储存信息的读取,利用模式细菌进行自主复制,通过对细菌进行简单测序,即可获得目的信息。本发明方法与现有的信息存储的方法相比,具有设计可控性,精确可寻址性等优势;且大大简化了利用DNA进行信息存储后读取的复杂步骤。

主权项:1.一种基于核酸纳米框架空间三维芯片的信息存储方法,其特征在于,包括以下步骤:步骤1:利用DNA折纸技术构建DNA纳米框架结构,并选定用于存储信息的位置序列;步骤2:将待存储信息所对应序列转化为相应互补序列,并分成若干条信息片段,所述信息片段均带有5’端的磷酸化修饰,根据信息片段以及在DNA纳米框架结构内部所选定的位置序列设计耦合序列;若干条所述信息片段的其中一条信息片段上还包含一段DNAzyme的互补序列,扩增后形成DNAzyme;步骤3:将耦合序列与DNA纳米框架结构孵育,使得位置序列与耦合序列部分杂交,以便信息片段后续的锚定;步骤4:将信息片段加入体系,再次进行孵育,使得信息片段与耦合序列进行充分的杂交,并保证信息片段之间的上游3’-OH与下游5’-P彼此邻接,在DNA纳米框架结构内部形成一个带有缺口的圆环;步骤5:加入T4连接酶孵育过夜,消除信息片段之间的缺口,使之成为一个完整的,封闭的环状信息模板,此时,即完成了信息在核酸纳米框架空间三维芯片内的存储。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 上海交通大学医学院附属仁济医院 基于核酸纳米框架空间三维芯片的自定义长单链DNA的制备方法与信息存储的应用

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