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申请/专利权人：上海纽仁生物医药科技有限公司
摘要：本发明公开了一种寻找结直肠癌患者是否会发生周围神经侵犯miRNA标志物的综合分析方法，属于生物技术领域。该方法包括：从TCGA某癌种队列中收集原始RNA测序数据和临床特征，随后分为PNI组和非PNI组；使用R包DESeq2分析在PNI组和非PNI组中的差异表达miRNA，以校正后P0.05且差异倍数的绝对值1.2作为筛选差异miRNA的阈值；对差异miRNA靶基因进行GO和KEGG通路富集分析；使用最小绝对收缩和选择算子LASSO回归分析对差异miRNA进行分析；从LASSO分析中获得最关键的PNI相关miRNA；使用每个miRNA的系数计算个体化的风险评分；使用ROC计算曲线下面积AUC，以评估模型辨别能力；然后在测试集中使用相同风险评分公式验证模型的准确性；统计分析。该方法操作简便、成本低、效率高，且无需借助特定的仪器、适合临床推广，通过该方法制备得到的miRNA标志物可用来进行结直肠癌是否会发生周围神经侵犯的分析，有利于深入研究结直肠癌的特性。
主权项：1.一种寻找结直肠癌患者周围神经侵犯miRNA标志物的综合分析方法，其特征在于，包括：从TCGA数据库中根据测序时的标注将结直肠癌患者分成周围神经侵犯组PNI组及非周围神经侵犯组非PNI组；将所述PNI组和非PNI组进行差异miRNA表达分析，经综合分析后共得到8个与结直肠癌患者周围神经侵犯相关的miRNA标志物。
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百度查询： 上海纽仁生物医药科技有限公司 一种寻找结直肠癌患者周围神经侵犯miRNA标志物的综合分析方法
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