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申请/专利权人:上海市东方医院(同济大学附属东方医院)
摘要:本发明公开了基于微血管侵犯特征基因的早期肝癌预后标志物、机器学习模型及其应用,涉及肝癌早期诊断或预后的生物标记物技术领域,其技术要点为:本发明提供了一种基于微血管侵犯MVI特征基因预测早期肝癌预后的模型和五个潜在的早期肝癌预后标志物;通过对早期肝癌患者的不同级别MVI样本进行空间转录组和单细胞核转录组测序,从而获得MVI区域的基因表达谱,这可直接得到MVI相关特征基因,并在此基础上结合TCGA数据构建基于MVI的早期肝癌预后预测模型,该机器学习模型可以用于预测早期、甚至是所有时期肝癌患者的预后;更重要的是,基于这个机器学习预测模型,发现了五个潜在的早期肝癌预后标志物,为临床的应用提供了更多的可能性和普适性。
主权项:1.基于微血管侵犯特征基因的早期肝癌预后标志物及其应用,其特征是:所述标志物包含GPX2、CANX、SLPI、CFL1和PIGO。
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