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免疫年龄预测方法、装置、电子设备、存储介质 

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申请/专利权人:珠海蓬生生物科技有限公司

摘要:本发明提出了一种免疫年龄预测方法、装置、电子设备、存储介质,方法包括:获取各个年龄层的PBMCs中的RNA‑seq样本数据,其中,RNA‑seq样本数据表征健康的RNA‑seq样本数据;对RNA‑seq样本数据进行特征筛选,得到样本基因集;通过预设的富集算法对样本基因集进行富集评分,得到样本富集分数;输入所述样本富集分数到预设模型进行训练和测试,得到预测免疫年龄模型;获取待测RNA‑seq数据的待测富集分数;将所述待测富集分数输入到训练完成的预测免疫年龄模型,得到预测免疫年龄。从而提高免疫年龄预测的准确性。

主权项:1.一种免疫年龄预测方法,其特征在于,包括:获取各个年龄层的PBMCs中的RNA-seq样本数据,其中,所述RNA-seq样本数据表征健康的RNA-seq样本数据;对所述RNA-seq样本数据进行特征筛选,得到样本基因集;通过预设的富集算法对所述样本基因集进行富集评分,得到样本富集分数;输入所述样本富集分数到预设模型进行训练和测试,得到预测免疫年龄模型;获取待测RNA-seq数据的待测富集分数;将所述待测富集分数输入到训练完成的所述预测免疫年龄模型,得到预测免疫年龄;所述通过预设的富集算法对所述样本基因集进行富集评分,得到样本富集分数,包括:获取所述RNA-seq样本数据的基因表达矩阵;对所述基因表达矩阵和所述样本基因集进行相同基因识别,得到第一基因集;根据所述第一基因集的集合情况确定所述样本富集分数;所述根据所述第一基因集的集合情况确定所述样本富集分数,包括:如果所述第一基因集为空集,则;如果所述第一基因集的基因数为1,对于每个所述RNA-seq样本数据,;如果所述第一基因集的基因数大于1,对于每个所述RNA-seq样本数据,;其中,为所述样本富集分数,为所述样本基因集,为同时在所述基因表达矩阵和基因集中的基因,j为样本标号,M为所述基因表达矩阵的个数,是的数目,k代表基因标号,rank(k,j)表示样本j中基因k的表达排名,表示样本j中基因的表达秩次排名。

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