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检测膀胱癌是否复发的装置和计算机可读存储介质 

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申请/专利权人:北京泛生子基因科技有限公司

摘要:本发明公开了检测膀胱癌是否复发的装置和计算机可读存储介质。本发明的装置通过检测待测膀胱癌患者的尿沉渣细胞的基因组DNA;基于基因组DNA中TERT基因16个位点的突变检测结果和ONECUT2基因的甲基化检测结果预测待测膀胱癌患者是否复发。TERT基因突变检测结果为阳性和或ONECUT2基因甲基化检测结果为阳性的膀胱癌患者预测为复发。本发明的装置检测无创,样本易获取,可用于指导不同复发风险患者的随访,降低低风险复发患者的膀胱镜使用次数,减少到医院就诊的次数和相关费用,从而提高患者的生活质量,并节省医疗资源。

主权项:1.检测或辅助检测膀胱癌患者是否复发的装置,其特征在于:所述装置包括如下模块:A1)样本获取模块:用于获取待测膀胱癌患者的尿沉渣细胞的基因组DNA;A2)基因突变检测和甲基化检测模块:用于基于所述基因组DNA进行所述待测膀胱癌患者基因组中TERT基因的突变检测和ONECUT2基因的甲基化检测;A3)风险预测模块:用于基于所述TERT基因的突变检测和ONECUT2基因的甲基化检测结果预测所述待测膀胱癌患者是否复发;所述TERT基因的突变是所述TERT基因的下述16个核苷酸位点中的至少一个位点存在突变:c.-45GT;c.-54CA;c.-57AC;c.62-63insCATT;c.-80CT;c.-86CT;c.-89CT;c.-93TG;c.-124CT;c.-124CA;c.-124_-125GGAA;c.-138CT;c.-139_-140GGTT;c.-139CT;c.-141GA;c.-146CT;所述“c.数字”表示所述突变在染色体上的位置,所述“-”表示在ATG翻译起始位点的上游,所述“”表示置换,所述“ins”表示插入,所述“_”表示以参考基因组的反义链为模版;所述ATG翻译起始位点为人参考基因组第5号染色体的第1295104位;所述突变为非同义突变。

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