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申请/专利权人：杭州翱锐基因科技有限公司
申请日：2024-04-25
公开（公告）日：2024-07-05
公开（公告）号：CN118298921A
主分类号：G16B30/10
分类号：G16B30/10;G16B40/00;G16B20/30
优先权：
专利状态码：在审-实质审查的生效
法律状态：2024.07.23#实质审查的生效;2024.07.05#公开
摘要：本发明提供了一种基于靶向甲基化测序和机器学习的癌症组织溯源系统；原发灶不明肿瘤Cancerofunknownprimary，CUP是一组罕见的恶性肿瘤，其预后不良且组织来源不明。利用不同组织和癌症类型中不同的DNA甲基化模式能够识别CUP患者的组织起源，有助于患者的风险评估和针对性治疗。本发明使用来自癌症基因组图谱TCGA的全基因组DNA甲基化图谱数据集和机器学习算法，开发了一个包含200个CpG甲基化特征的分类器，用于CUP组织来源预测，具有较高的准确性。
主权项：1.一种基于靶向甲基化测序和机器学习的癌症组织溯源系统，其特征在于，所述系统包括：数据采集模块，采集癌症组织中的甲基化测序数据；甲基化特征筛选模块，基于数据采集模块采集的甲基化测序数据，使用机器学习算法，筛选最高变量重要性的多个甲基化特征；癌症组织溯源预测模块，基于甲基化特征筛选模块筛选得到的甲基化特征，使用机器学习算法构建预测模型；癌症组织溯源计算模块，基于患者的临床组织样本获取靶向甲基化测序数据，输入癌症组织溯源预测模块的预测模型，计算得到癌症的组织来源。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 杭州翱锐基因科技有限公司 一种基于靶向甲基化测序和机器学习的癌症组织溯源系统
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