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申请/专利权人：温州医科大学
申请日：2024-03-27
公开（公告）日：2024-06-14
公开（公告）号：CN118197406A
主分类号：G16B20/20
分类号：G16B20/20;G16B30/10
优先权：
专利状态码：在审-实质审查的生效
法律状态：2024.07.02#实质审查的生效;2024.06.14#公开
摘要：本发明提供了一种用于评估微生物与宿主细胞之间关联的评分方法、系统、设备、介质和程序产品，涉及生物学领域。所述方法包括：获取微生物GWAS数据、宿主单细胞转录组数据；采用多基因评分方法分析所述微生物GWAS数据，得到微生物和宿主基因关联的Z分数；基于所述Z分数筛选得到微生物相关基因；从所述单细胞转录组数据筛选出所述微生物相关基因的表达水平，根据表达水平量化得到原始细菌多基因评分，即第一原始BPS；如果所述第一原始BPS大于等于第一阈值，得到微生物与细胞之间关联强的结果。通过将scRNA‑seq技术和GWAS技术相结合，以研究与复杂疾病或肠道微生物显著相关的细胞群。
主权项：1.用于评估微生物与宿主细胞之间关联的评分方法，其特征在于，所述方法包括：获取微生物的GWAS数据、单细胞转录组数据；采用多基因评分方法分析所述微生物的GWAS数据，得到微生物和宿主基因关联的Z分数；基于所述Z分数筛选得到微生物相关基因；从所述单细胞转录组数据筛选出所述微生物相关基因的表达水平，根据表达水平量化得到原始细菌多基因评分，即第一原始BPS；如果所述第一原始BPS大于等于第一阈值，得到微生物与细胞之间关联强的结果。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 温州医科大学 用于评估微生物与宿主细胞之间关联的评分方法和系统
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