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申请/专利权人：中山大学
摘要：本发明公开了一种基于核酸等温扩增的全基因组5hmC水平的定量方法及其应用，其主要基于全基因组5hmC检测探针组，使用葡糖基转移酶修饰技术以及链置换线性等温扩增技术实现对全基因组5hmC含量测定。本发明中的检测方法特异性强，能抗C，5mC，5fC和5caC等相似的衍生物的干扰，而且灵敏性强，5hmC线性检测范围为0.016％～0.16％5hmC总DNA，检出限约为0.003％，可以满足痕量样品检测需求，推动了全基因组5hmC含量检测在癌症等疾病检测或监控中的应用。
主权项：1.一组5hmC检测探针，其特征在于，所述5hmC检测探针包括模型链、引物链和模板链；其中，所述模型链的核苷酸序列为：5’-GAGACCGGAGTCCGCTTTCCTCTTCCGGAAAATGTAAGCCGAACCTAAAGCAATCACCAGGG-3’（SEQIDNO.1）；所述模型链核苷酸序列中的自5’端第26位碱基C为5hmC；所述引物链的核苷酸序列为：5’-GATCGGAAGAGCAGTCGTCTGAACTCCAGTCAC-3’（SEQIDNO.3）；所述引物链5’端连接有二苯并环辛炔；所述模板链的核苷酸序列为：5’-ATTCCGTATTAGTAGATCTCTCTCTCCTCGAGACGTGACTGGAGTTCAGACGTGTGCTCTTCCG-3’（SEQIDNO.4）；使用所述5hmC检测探针检测5hmC的方法为：（1）将模型链或样品DNA中的5hmC修饰为N3-5gmC；（2）将修饰后的模型链或样品DNA与引物链结合得到5gmC探针；（3）将5gmC探针与DNA模板链进行链置换线性等温扩增，根据扩增产物的荧光信号强度计算样品中的5hmC含量。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 中山大学 一种基于核酸等温扩增的全基因组5hmC水平的定量方法及其应用
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