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一种毛细管电泳荧光STR图谱基因型分型方法 

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申请/专利权人:上海犀骥数字科技有限公司

摘要:本发明公开了一种毛细管电泳荧光STR图谱基因型分型方法,属于法医遗传学领域。本方法包括:首先读取荧光数据文件中的信息,对每个荧光信道,使用滑窗搜索算法,搜索荧光信号中的峰,利用指定概率分布对搜索到的峰进行拟合,确定峰的参数;在内标信道内的利用特定性质,筛选正确内标峰;建立样本的内标峰与等位基因分型标准物的内标峰的时间映射关系;建立等位基因分型标准物等位基因峰的峰时间与峰长度映射关系;由此,与等位基因标准物的长度比较确定样本的峰的峰长度,获得基因分型结果。本发明将荧光数据文件转化成可视化STR图谱,成本低,且提高了基因型分析的可观性。

主权项:1.一种毛细管电泳荧光STR图谱基因型分型方法,其特征在于,包括:S1、读取荧光数据文件中的信息;S2、对每个荧光信号的信道,使用滑窗搜索算法,搜索荧光信号中的峰,利用指定概率分布对搜索到的峰进行拟合,确定峰的参数;S3、在内标信道内的利用特定性质筛选正确内标峰;S4、建立样本的内标峰与等位基因分型标准物的内标峰之间的时间映射关系;S5、建立等位基因分型标准物等位基因峰的峰时间与峰长度映射关系;S6、利用S4和S5建立的两类映射关系,确定样本峰长度,从而得到峰基因分型结果。

全文数据:

权利要求:

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