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一种Y-STR荧光标记复合扩增检测体系及其应用 

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申请/专利权人:公安部鉴定中心

摘要:本发明公开Y‑STR荧光标记复合扩增检测体系及其应用,复合扩增检测体系包括10个多拷贝Y‑STR基因座、16个单拷贝Y‑STR基因座、3个Y‑indel遗传标记和3个内部质量参考,以及对应的33个引物对,每个引物对均携带荧光染料标记物。上述Y‑STR荧光标记复合扩增检测体系可用于男性家系精细化排查。本发明能够在案件检材初步检验的基础上,增加尽可能多的Y‑STR基因座,使最终获得的分型能够达到公安部刑侦局推荐的Y‑STR核心和优选基因座的要求,全面满足Y‑STR入库比对及后期检验排查的要求;该体系将可应用于男性家系排查中的精细化识别,为侦查办案提供技术支撑。

主权项:1.一种Y-STR荧光标记复合扩增检测组合物,其特征在于,包括10个多拷贝Y-STR基因座、16个单拷贝Y-STR基因座、3个Y-indel遗传标记和3个内部质量参考,以及对应的33个引物对,每个引物对均携带荧光染料标记物;10个多拷贝Y-STR基因座分别为DYF371、DYF383S1、DYF399S1、DYF403S1、DYF404S1、DYF409S1、DYF411S1、DYS464、DYS526和DYS527;DYF403S1包含DYF403S1a、DYF403S1b1和DYF403S1b2,DYS526包含DYS526a和DYS526b;16个单拷贝Y-STR基因座分别为DYS388、DYS444、DYS447、DYS458、DYS508、DYS522、DYS547、DYS549、DYS557、DYS593、DYS596、DYS612、DYS622、DYS626、DYS643和DYS645;3个Y-indel遗传标记分别为rs199815934、rs759551978和rs771783753;3个内部质量参考分别为QC1、QC2和QC3;10个多拷贝Y-STR基因座中:DYF371的上游引物序列和下游引物序列分别为SEQIDNO.59和SEQIDNO.60;DYF383S1的上游引物序列和下游引物序列分别为SEQIDNO.25和SEQIDNO.26;DYF399S1的上游引物序列和下游引物序列分别为SEQIDNO.11和SEQIDNO.12;DYF403S1有2对扩增引物,第1对引物扩增DYF403S1a,其上游引物序列和下游引物序列分别为SEQIDNO.35和SEQIDNO.36,第2对引物扩增DYF403S1b1和DYF403S1b2,其上游引物序列和下游引物序列分别为SEQIDNO.49和SEQIDNO.50;DYF404S1的上游引物序列和下游引物序列分别为SEQIDNO.9和SEQIDNO.10;DYF409S1的上游引物序列和下游引物序列分别为SEQIDNO.37和SEQIDNO.38;DYF411S1的上游引物序列和下游引物序列分别为SEQIDNO.33和SEQIDNO.34;DYS464的上游引物序列和下游引物序列分别为SEQIDNO.61和SEQIDNO.62;DYS526的上游引物序列和下游引物序列分别为SEQIDNO.5和SEQIDNO.6;DYS527的上游引物序列和下游引物序列分别为SEQIDNO.29和SEQIDNO.30;16个单拷贝Y-STR基因座中:DYS388的上游引物序列和下游引物序列分别为SEQIDNO.57和SEQIDNO.58;DYS444的上游引物序列和下游引物序列分别为SEQIDNO.39和SEQIDNO.40;DYS447的上游引物序列和下游引物序列分别为SEQIDNO.41和SEQIDNO.42;DYS458的上游引物序列和下游引物序列分别为SEQIDNO.17和SEQIDNO.18;DYS508的上游引物序列和下游引物序列分别为SEQIDNO.15和SEQIDNO.16;DYS522的上游引物序列和下游引物序列分别为SEQIDNO.13和SEQIDNO.14;DYS547的上游引物序列和下游引物序列分别为SEQIDNO.53和SEQIDNO.54;DYS549的上游引物序列和下游引物序列分别为SEQIDNO.21和SEQIDNO.22;DYS557的上游引物序列和下游引物序列分别为SEQIDNO.23和SEQIDNO.24;DYS593的上游引物序列和下游引物序列分别为SEQIDNO.19和SEQIDNO.20;DYS596的上游引物序列和下游引物序列分别为SEQIDNO.43和SEQIDNO.44;DYS612的上游引物序列和下游引物序列分别为SEQIDNO.63和SEQIDNO.64;DYS622的上游引物序列和下游引物序列分别为SEQIDNO.47和SEQIDNO.48;DYS626的上游引物序列和下游引物序列分别为SEQIDNO.51和SEQIDNO.52;DYS643的上游引物序列和下游引物序列分别为SEQIDNO.65和SEQIDNO.66;DYS645的上游引物序列和下游引物序列分别为SEQIDNO.27和SEQIDNO.28;3个Y-indel遗传标记中:rs199815934的上游引物序列和下游引物序列分别为SEQIDNO.1和SEQIDNO.2;rs759551978的上游引物序列和下游引物序列分别为SEQIDNO.3和SEQIDNO.4;rs771783753的上游引物序列和下游引物序列分别为SEQIDNO.31和SEQIDNO.32;3个内部质量参考中:QC1的上游引物序列和下游引物序列分别为SEQIDNO.7和SEQIDNO.8;QC2的上游引物序列和下游引物序列分别为SEQIDNO.45和SEQIDNO.46;QC3的上游引物序列和下游引物序列分别为SEQIDNO.55和SEQIDNO.56;对应的33个引物对按携带荧光染料标记物的种类分为六组:第一组为rs199815934、rs759551978、DYS526a、DYF404S1、QC1、DYF399S1、DYS526b和DYS522,荧光染料标记物为蓝色荧光染料FAM;第二组为DYS508、DYS458、DYS593、DYS549、DYS557、DYF383S1、DYS645和DYS527,荧光染料标记物为绿色荧光染料HEX;第三组为rs771783753、DYF411S1、DYF403S1a、DYF409S1、DYS444、DYS447和DYS596,荧光染料标记物为黄色荧光染料L550;第四组为QC2、DYS622、DYF403S1b1、DYS626、DYF403S1b2和DYS547,荧光染料标记物为红色荧光染料LR600;第五组为QC3、DYS388、DYF371、DYS464、DYS612和DYS643,荧光染料标记物为紫色荧光染料L592;第六组为分子量内标,荧光染料标记物为橙色荧光染料。

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