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申请/专利权人：四川大学

摘要：本发明涉及法医物证学技术领域，具体公开了一种针对肿瘤组织STR图谱进行身源鉴定的证据强度评估方法。本发明建立了分析肿瘤组织这一混合物的gamma模型，并在模型中考虑STR变异的概率，以生物学模型和统计学原理为基础，通过设定和两个互斥假设命题，计算证据权重LR的置信区间，推断构成肿瘤组织混合物的所有可能的细胞群的基因型组合，并对这些可能的组合进行排序，达到肿瘤组织个人识别的目的。

主权项：1.针对肿瘤组织STR图谱进行身源鉴定的证据强度评估万法，其特征在于：包括以下步骤：步骤S1、分别提取待测肿瘤组织样本的细胞DNA和可疑身源正常组织样本的细胞DNA，将提取到的DNA进行定量、稀释后，用毛细管电泳技术进行STR分型，获取基因座、等位基因和峰高；步骤S2、显微镜下观察待测肿瘤组织样本蜡块HE染色切片，判断肿瘤细胞占比Mx，正常细胞占比为mx1＝1-Mx，收集待测肿瘤组织样本的STR基因座变异率，作为先验参数；步骤S3、根据待测肿瘤组织样本的STR图谱数据，使用最大等位基因计数法，确定待测肿瘤组织样本中细胞群总数K，K≥2；步骤S4、设置互斥假设命题Hp、Hd，其中假设命题Hp为肿瘤组织由一个已知个体的正常细胞群及其突变而来的K-1个肿瘤细胞群组成；假设命题Hd为肿瘤组织由一个随机无关个体的正常细胞群及其突变而来的K-1个肿瘤细胞群组成；步骤S5、根据细胞群总数K，每个基因座均生成候选基因型组合的集合；步骤S6、每个基因座上，针对每种基因型组合，利用gamma模型计算出现该峰高组合的概率；利用变异率模型计算给定假设命题HpHd下，出现该基因型组合的概率，具体地，任一常染色体基因座m上，在给定假设命题H和变异率条件下，观察到基因型组合gm的概率为： 其中， gn为正常细胞群的基因型；Pgn|H为在给定假设命题H和给定变异率条件下，正常细胞群基因型概率；杂合子基因型概率为两个等位基因频率的乘积乘2；纯合子基因型概率为该等位基因频率的平方；若基因型中存在可能丢失的等位基因Q，则该等位基因频率为1-该基因座上的等位基因频率之和；gt＝gt，1，...，gt，k为肿瘤细胞群的基因型向量；gt，k，a＝gt，k，a1，gt，k，a2为第k个肿瘤细胞群的等位基因向量； 为在给定假设命题H和给定变异率条件下，观察到第k个肿瘤细胞群基因型的条件概率； 表示特定基因座m上的肿瘤细胞群基因型条件概率的乘积； 为在给定假设命题H和给定变异率条件下，肿瘤细胞来源等位基因a的概率；步骤S7、联合所有基因座，写出给定假设命题和对应参数下LR的似然函数；步骤S8、求取假设命题Hp和假设命题Hd下的似然值最大时对应的参数取值以及最大似然值，计算LR；步骤S9、固定假设命题Hd下优化寻参结果，计算每个基因座上包含参考图谱基因型的基因型组合的后验概率，并排序；步骤S10、在[mx1±10％]的范围内均匀取21个点作为先验参数；重复S6-S9步骤，分别计算在不同mx1下的LR值以及基因型组合的后验概率，并进行排序；步骤S11、设立以下两种Hd假设命题，重复S6-S10步骤，分别计算在不同mx1下的LR值；HdPO：肿瘤组织由已知个体的亲子对的正常细胞群及其突变而来的K-1个肿瘤细胞群组成；HdFS：肿瘤组织由已知个体的全同胞对的正常细胞群及其突变而来的K-1个肿瘤细胞群组成。

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