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申请/专利权人:深圳市城管宣教和发展研究中心;广东省农业科学院环境园艺研究所;深圳市仙湖植物园(深圳市园林研究中心)
摘要:本发明公开了一种EST‑SSR标记组合及其在评价萱草品种遗传多样性及开花性状连锁分析中的应用,属于分子生物学领域。本发明利用转录组测序大量开发EST‑SSR标记,筛选出20对高多态性的EST‑SSR标记,可用于萱草不同资源间的遗传多样性评价。同时基于20对高多态性的EST‑SSR标记和花色、花葶高度、花朵直径、开花早晚、开花天数、连续开花特性6个表型性状进行连锁分析,获得与花朵直径等表型性状的显著相关的EST‑SSR标记,并解释了表型变异。综上,本发明提供的EST‑SSR标记组合,将加快推进萱草种质资源的分子辅助育种进程,为今后培育更多的优良萱草新品种提供技术支撑。
主权项:1.EST-SSR标记组合,其特征在于,包括编号为HF3、HF4、HF5、HF10、HF12、HF13、HF19、HF21、HF28、HF29、HF31、HF34、HF36、HF38、HF39、HF41、HF44、HF47、HF50、HF55的20对多态性EST-SSR标记;其中:HF3引物序列为:正向引物:TGACGGTGGAGGAGGGTTTA;反向引物:TACTGCACTGTAGGGCTCCT;HF4引物序列为:正向引物:AGGTGGTGAGGCTGTAGGAT;反向引物:CGAAGACACTCTATCCGCCC;HF5引物序列为:正向引物:GCCCCTCCATTGGCTTATCT;反向引物:CGAAGCAGCTGGAGAGAGAG;HF10引物序列为:正向引物:TCCGAACGTGGTCAATCCTT;反向引物:CGCAAGTGCATGCTACCATT;HF12引物序列为:正向引物:CCACCATCAAACGAGCATAGC;反向引物:TATTGTACATGAGGCGGCGG;HF13引物序列为:正向引物:AGAGCAATGGAAGTGGCTCC;反向引物:TTAGGACGGAGCACTCTGGAHF19引物序列为:正向引物:AGGAGGAGGAGCAGTCTCAG;反向引物:GGCCGAGTATCGCTGCTTATHF21引物序列为:正向引物:ACCAAGAAGTCAACCGCCTT;反向引物:CACTCTCCGATCGCTTCTCC;HF28引物序列为:正向引物:CTAGTAGTGGTGGTGGTGGC;反向引物:ATAGCCACCTGCAGCTGTTT;HF29引物序列为:正向引物:GATGAAGCCGATGCCAAACC;反向引物:TCCTTCCTGCGCTCTTTTCT;HF31引物序列为:正向引物:GAGGGTGGGAAGCTTCTGAG;反向引物:ACGAACCCGCATCAGATCAA;HF34引物序列为:正向引物:CAAGAGGGACTTCAGCGAGG;反向引物:TCCTCTCGAACAACAGGCAC;HF36引物序列为:正向引物:ACCAGCCATATGCCTTGAACT;反向引物:AACAAAGCCCGTACCCCAAA;HF38引物序列为:正向引物:GTGCTTCCAGGCCCAACTTA;反向引物:ATGATGGAAGGTCTGATGCATCCT;HF39引物序列为:正向引物:TGTATTTGACACAGCAAGGCG;反向引物:TACCAAAGCACGGTGGCTAG;HF41引物序列为:正向引物:TTCATGGCCAGTTCTCGCTT;反向引物:TCGTGCACCTTCCTCTTTGA;HF44引物序列为:正向引物:CGAGTACATTGGGGCAAAGC;反向引物:TGACCTGCATGACTACACGG;HF47引物序列为:正向引物:AAAGCAAAGGGGCACACAAC;反向引物:GAGGAAGTGACAGAGGTGGC;HF50引物序列为:正向引物:AGGGCTAAGAGAGAGAGGGC;反向引物:ACGAGGGGTTTCTTCTTCCTC;HF55引物序列为:正向引物:AGCAAAGCAATAAAATAGACAGCA;反向引物:TTACTCTCCGCCCACCTCAT。
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