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检测APEC、UPEC毒力基因表达水平的DNA芯片及其构建方法 

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申请/专利权人:扬州大学

摘要:检测APEC、UPEC毒力基因表达水平的DNA芯片及其构建方法,属于人兽共患病技术领域,先扩增大肠杆菌已知的毒力基因和部分耐药基因的97个基因片段、用SSH方法获得的APEC特异性基因的44个基因片段、用SCOTS方法获得的APEC特异性基因的13个基因片段;再以重组质粒为模板,将各基因片段回收并纯化;然后,用SmartArrayTM microarrayer点样于化学修饰的载玻片上,同时设置阳性对照和阴性对照,构建154个靶基因探针的DNA芯片,用于检测APEC、UPEC毒力基因表达水平。

主权项:检测APEC、UPEC毒力基因表达水平的DNA芯片,其特征在于:包含154个靶基因探针的DNA芯片;其中97个基因片段扩增自大肠杆菌已知的毒力基因和部分耐药基因,44个基因片段扩增自用SSH方法获得的APEC特异性基因,13个基因片段扩增自用SCOTS方法获得的APEC特异性基因;所述97个基因片段是:fimC、fimH、tsh、iroN、irp2、fyuA、kpsM、csgA、papC、felA、facA、cvaC、iss、iucCD、vat、bmaE、hlyE、cnf1、chuA、hlyA、iutA、sitA、kfiB、papGII、papGIII、ireA、focG、malX、afaBC、sfaDE、gyrB、recA、mdh、uspA、sepL、fepC、rtx、ehxA、espP、flic、iha、tir、eae、ler、stx1、stx2、rfbE、paa、katP、neuC、etpD、toxB、tagA、cesT、pas、espA、cdtA、east、bfpA、cif、efaI、sheA、perA、espB、ompA、faeG、fanC、fasA、f41、f17a‑A、lt、sta、stb、stx2eB、tetA、tetB、tetG、blaTEM‑1、carb2、addA1、sulI、sulII、addA2、strA‑B、qac、int‑I、cat I、floR、aac3‑IV、dfr‑12、aph3‑Ia、cmlA、uidA、fhuA、yjaA、feoB、16srDNA;所述由SSH方法获得的44个基因片段是:ecs‑1、ecs‑6、ecs‑7、ecs‑8、ecs‑9、ecs‑10、ecs‑11、ecs‑12、ecs‑13、ecs‑14、ecs‑15、ecs‑16、ecs‑17、aes‑1、aes‑2、aes‑3、aes‑4、aes‑5、aes‑6、aes‑7、aes‑8、aes‑9、aes‑10、aes‑11、aes‑12、aes‑13、aes‑14、aes‑15、aes‑16、aes‑17、aes‑18、aes‑19、aes‑20、aes‑21、aes‑22、aes‑23、aes‑24、aes‑25、aes‑27、aes‑28、aes‑29、aes‑30、aes‑31、aes‑32;所述由SCOTS方法获得的13个基因片段是:aec‑8、aec‑11、aec‑13、aec‑14、aec‑18、aec‑20、aec‑24、aec‑25、aec‑26、aec‑27、aec‑29、aec‑30、aec‑31。

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