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龙图腾网恭喜电子科技大学(深圳)高等研究院申请的专利基于多距离谱嵌入融合的单细胞甲基化数据聚类方法获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN114298201B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-03-28发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202111589061.2，技术领域涉及：G06F18/23；该发明授权基于多距离谱嵌入融合的单细胞甲基化数据聚类方法是由凡时财;田奇;邹见效;徐红兵设计研发完成，并于2021-12-23向国家知识产权局提交的专利申请。

本基于多距离谱嵌入融合的单细胞甲基化数据聚类方法在说明书摘要公布了：本发明公开了一种基于多距离谱嵌入融合的单细胞甲基化数据聚类方法，获取待聚类的细胞的单细胞甲基化数据并进行二值化处理，根据得到的单细胞甲基化数据计算得到细胞之间的余弦距离矩阵、海明距离矩阵和皮尔逊距离矩阵，利用光谱嵌入方法根据三个距离矩阵获取细胞的三个低维谱嵌入表示矩阵，将三个低维谱嵌入表示矩阵按列合并得到特征矩阵，将特征矩阵中的行向量作为细胞的特征表示向量，两两计算细胞间特征表示向量之间的欧氏距离，得到甲基化距离矩阵，基于甲基化距离矩阵进行层次聚类，获取细胞聚类结果。本发明通过融合多个距离矩阵的低维谱嵌入成分，提升了单细胞甲基化数据聚类的准确性。

本发明授权基于多距离谱嵌入融合的单细胞甲基化数据聚类方法在权利要求书中公布了：1.一种基于多距离谱嵌入融合的单细胞甲基化数据聚类方法，其特征在于，包括以下步骤：S1：获取待聚类的N个细胞的单细胞甲基化数据，记细胞i对应的甲基化数据为X′i，i＝1,2,…,N；对每个单细胞的甲基化数据X′i进行二值化预处理，得到二值化后的甲基化数据Xi；S2：对于步骤S1得到的单细胞甲基化数据，计算任意两个单细胞甲基化数据Xi和Xj之间的余弦距离DM1Xi,Xj、海明距离DM2Xi,Xj和皮尔逊距离DM3Xi,Xj，i,j＝1,2,…,N，构成N阶的余弦距离矩阵DM1、海明距离矩阵DM2和皮尔逊距离矩阵DM3；S3：利用光谱嵌入方法，分别获取步骤S2获得的三个距离矩阵对应的低维谱嵌入表示矩阵，具体方法如下：首先分别根据余弦距离矩阵DM1、海明距离矩阵DM2和皮尔逊距离矩阵DM3生成每个距离矩阵对应的加权图Gp，p＝1,2,3，具体方法为：将所有细胞作为加权图Gp的顶点，根据距离矩阵DMp获得每个细胞i的K个最近邻居集合φi，K的值根据实际情况设置，判断细胞之间的相邻情况：如果细胞i和细胞j不互为最近邻居，即或则认为细胞i和细胞j不相邻，如果细胞i和细胞j互为最近邻居，即i∈φj且j∈φi，则认为细胞i和细胞j相邻；然后采用热内核函数为每条边分配权重计算公式如下： 其中，e表示自然常数；根据加权图Gp得到加权邻接矩阵Wp；然后对3个加权邻接矩阵Wp进行谱嵌入，生成3个基本距离矩阵DMp对应的低维谱嵌入表示矩阵： 其中，ypi＝ypi1,ypi2,…,ypiR表示Yp中第i个细胞对应的嵌入向量，ypir表示嵌入向量ypi中的第r个特征值，r＝1,2,…,R，R表示嵌入维度；S4：将步骤S3获得的3个低维谱嵌入表示矩阵Yp按列合并生成一个N×3R的特征矩阵FM＝[Y1Y2Y3]，然后将特征矩阵FM中的第i个行向量FMi作为细胞i的特征表示向量fi，两两计算细胞间特征表示向量fi的欧氏距离，得到N阶的距离矩阵，即作为甲基化距离矩阵S5：基于甲基化距离矩阵进行层次聚类，获取细胞聚类结果。

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