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申请/专利权人:四川大学华西医院
摘要:本发明提供了一种早期肺腺癌由MIA到IA进展预测方法及其风险评分模型构建方法,属于疾病进展预测技术领域。本发明采用755例早期肺腺癌临床样本进行了1021个基因的大panel基因检测,并基于所得数据构建得到了肺腺癌预后风险评分模型以及对应的肺腺癌发展预测方法,具有优异的适用性,多种数据集验证结果表明其能够实现早期肺腺癌进展有效预测,在临床中实现肺腺癌的早期发现、精准预测和及时治疗。本发明中肺腺癌预后风险评分模型的构建方法利用了特定的差异突变基因和核心算法模型,所述差异突变基因与影像、病理分化程度和肿瘤大小密切相关,使构建方法更加科学准确,提升所得早期肺腺癌预后风险评分模型的临床应用价值。
主权项:1.一种早期肺腺癌由MIA到IA进展预测方法,其特征在于,包括以下步骤:S1、获取多个样本中目的基因集的突变情况;S2、将S1所得结果通过以下公式进行计算,得到多个样本的风险评分;风险评分=1.83331403*GTP53+1.24152921*GCDKN2A+2.02331501*GSETD2-1.54969391*GERBB2-1.75892268*GBRAF-1.66240923*GTSC1-1.59870732*GMAP2K1-0.46874594*GCDKN1B-0.79330108*GJUN-1.24918034*GAKT1-0.75809038*GHIST1H1D式中,所述GTP53为样本中TP53基因的突变情况,发生突变记为1,未发生突变记为0;所述GCDKN2A为CDKN2A基因的突变情况,发生突变记为1,未发生突变记为0;所述GSETD2为SETD2基因的突变情况,发生突变记为1,未发生突变记为0;所述GERBB2为ERBB2基因的突变情况,发生突变记为1,未发生突变记为0;所述GBRAF为BRAF基因的突变情况,发生突变记为1,未发生突变记为0;所述GTSC1为TSC1基因的突变情况,发生突变记为1,未发生突变记为0;所述GMAP2K1为MAP2K1基因的突变情况,发生突变记为1,未发生突变记为0;所述GCDKN1B为CDKN1B基因的突变情况,发生突变记为1,未发生突变记为0;所述GJUN为JUN基因的突变情况,发生突变记为1,未发生突变记为0;所述GAKT1为AKT1基因的突变情况,发生突变记为1,未发生突变记为0;所述GHIST1H1D为HIST1H1D基因的突变情况,发生突变记为1,未发生突变记为0;S3、根据所得多个样本的风险评分计算得到中位数,风险评分大于所述中位数的样本预测为早期肺腺癌发展高风险,风险评分小于所述中位数的样本预测为早期肺腺癌发展低风险。
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