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一种取代基工程下基态结构预测方法 

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申请/专利权人:温州大学

摘要:本发明公开了一种取代基工程下基态结构预测方法,涉及基态结构预测技术领域。该取代基工程下基态结构预测方法,包括以下步骤:获取候选种子异构体;基于榫卯模型对候选种子异构体进行能量预测;建立数据库并存储进行能量预测后的候选种子异构体及候选种子异构体对应的结构,不仅考虑了所有可能的基态结构基于双势能面的“种子”策略,还考虑了取代基的多样性和大规模计算的预测可靠性基于“种子”和“榫卯”策略的详尽搜索。因此,本发明可以衍生出的研究范式具有普遍性,可应用于取代基工程下各类团簇的结构规律研究。

主权项:1.一种取代基工程下基态结构预测方法,其特征在于,包括以下步骤:获取候选种子异构体;基于榫卯模型对候选种子异构体进行能量预测;建立数据库并存储进行能量预测后的候选种子异构体及候选种子异构体对应的结构;所述获取候选种子异构体,包括:构建基础骨架;基于基础骨架获取初始种子异构体;筛选要求能量范围内的初始种子异构体作为候选种子异构体;所述基于基础骨架获取初始种子异构体,包括:利用团簇生长模式将取代基作为配体并逐个添加到基础骨架中,获取初始种子异构体;所述基于榫卯模型对候选种子异构体进行能量预测,包括:基于基因序列获取A-G下权值为x的模型的能量以及A-A下权值为y的模型的能量,其中A为基因异构体,G为取代基;获取正八面体骨架能量;基于A-G下权值为x的模型的能量,A-A下权值为y的模型的能量和正八面体骨架能量获取候选种子异构体的能量;获取A-G下权值为x的模型的能量以及A-A下权值为y的模型的能量的过程如下:确定作为骨架的候选种子异构体;确定该候选种子异构体包含的取代基;确定各取代基所占用的位点;基于确定的候选种子异构体、该候选种子异构体包含的取代基和各取代基所占用的位点从数据库中搜索A-G下权值为x的模型和A-A下权值为y的模型;获取A-G下权值为x的模型的能量以及A-A下权值为y的模型的能量;所述候选种子异构体的能量的计算公式如下: ;式中,为候选种子异构体的能量,为A-G下权值为x的模型的能量,为A-A下权值为y的模型的能量,为正八面体骨架能量;所述A-G下权值为x的模型的能量的计算公式如下: ;式中,为A-G下权值为x的模型真实计算的能量;所述A-A下权值为y的模型的能量的计算公式如下: ;式中,为A-G下权值为y的模型真实计算的能量。

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