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申请/专利权人：杭州茵菲多组学生物科技有限公司
摘要：本发明提供一种基于组织原位质谱成像技术的非小细胞肺癌免疫检查点抑制剂疗法疗效评估方法及系统，以组织质谱影像为基础，进行多维分析，在确保分析质量稳定的前提下，多元化地还原和解读ICIs疗效的影响因素，能够更为准确地为临床效益提供参考依据。本发明的系统和方法具有计算机算法、生物学和统计学等多种科学理论的支持，避免了陈旧方法中因环境因素与观测者主观因素造成的误差，能更全面、更系统地将实验样本数据中的所有细胞类型，以及可能的空间组织结构全面组合分析，能够尽量避免单一分析带来的视角问题。
主权项：1.基于组织原位质谱成像技术的非小细胞肺癌免疫检查点抑制剂疗法疗效评估方法，其特征在于，所述评估方法按照以下步骤进行：（1）获取所需组织质谱影像；（2）对组织质谱影像进行图像预处理；（3）细胞分割与数据收集：使用基于深度学习的卷积神经网络模型进行细胞图像分析，将组织质谱影像的多通道信息作为特征，进行分割和分类，并收集为下游分析可用的数据，具体包括以下步骤：（3.1）基于DeepCell的细胞分割算法，对预处理后的图像进行细胞分割；（3.2）依次对不同ROI的图像提取分割后每个细胞的空间位置、不同通道内的信号表达量、与ROI内近邻细胞的数量、近邻细胞的索引CellID、每个细胞与近邻细胞的空间距离、及每个细胞与所有近邻细胞的空间距离的平均值，并依据ROI依次将细胞信息导出为.csv格式数据文件；（3.3）根据通道与蛋白对应信息，与每个样本不同ROI的批次、面积、分组信息，分别构建用于生信分析的数据信息表；（3.4）根据包含每个细胞信息的格式数据文件和数据信息表，构建数据结构对象，用于存储每个ROI的细胞信息、蛋白表达量信息、分组信息、批次信息、ROI面积及其他数据信息表中存储的信息；（4）组织质谱影像下游分析：使用步骤（3）获取的数据，通过包括细胞聚类和细胞注释在内的手段进行对组织质谱影像中的细胞进行分析，获得细胞分布差异、细胞相关性和相互作用关系信息。
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权利要求：
百度查询： 杭州茵菲多组学生物科技有限公司 基于组织原位质谱成像技术的非小细胞肺癌免疫检查点抑制剂疗法疗效评估方法及系统
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