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申请/专利权人:中国农业大学三亚研究院
摘要:本发明公开了一种Zophobasatratus防御素高效信号肽筛选菌株的构建方法,属于生物技术领域。本发明采用的步骤如下:(一)重组表达载体的构建;(二)构建基因工程菌;(三)诱导表达和产物鉴定。本发明通过构建Zophobasatratus防御素高效信号肽菌株,通过原核表达技术获得天然抗菌肽,克服了生产成本高,在本体动物中提取产量低的问题,并使其成为畜牧养殖中抗生素有效替代品。本发明筛选了表达宿主枯草芽孢杆菌五种信号肽,并提高其产量,同时验证了目标蛋白对多种多重耐药致病菌的抑制活性。
主权项:1.一种表达Zophobasatratus防御素和信号肽融合基因的枯草芽孢杆菌工程菌的构建方法,其特征在于,步骤如下:一重组表达载体的构建;二构建基因工程菌;三诱导表达和产物鉴定;步骤一重组表达载体的构建,具体步骤如下:1五种信号肽基因PCR扩增:五种信号肽基因为SPbpr、SPdacB、SPeapD、SPlytE、SPwapA,其核苷酸序列如SEQIDNO:1-5所示,其氨基酸序列如SEQIDNO:6-10所示;2抗菌肽基因的合成以及克隆载体的构建:抗菌肽基因为Zophobasatratus防御素,其核苷酸序列如SEQIDNO:12所示,其氨基酸序列如SEQIDNO:11所示;抗菌肽基因使用RACE-PCR扩增,确定核苷酸序列,核苷酸序列5’端和3’端同时带有BamhI酶切位点,并连接至克隆载体PUC57,形成重组载体PUC57-ZD;抗菌肽基因的氨基酸序列N端带有6个HIS标签;通过PCR反应体系扩增信号肽基因序列,并进行切胶回收:通过PCR反应体系扩增抗菌肽基因序列,并进行切胶回收:3表达载体提取与酶切:将含有表达载体PMA5的大肠杆菌接种5ml含有100μgmL氨苄西林的LB液体培养基中,37℃,200rpm过夜培养,提取质粒,将提取的质粒进行单酶切,用于后续同源重组;4Zophobasatratus防御素和信号肽融合基因连接至表达载体:通过同源重组技术将Zophobasatratus防御素和信号肽融合基因连接至线性化表达载体PMA5,得到重组载体PMA5-SPn-ZD,连接反应体系如下:线性化载体,160ng;目的基因,20ng;同源重组酶,5μl;ddH2O,补齐至10μl;同源重组反应条件为50℃,5min,将连接产物转化至克隆载体DH5α,随后涂布于含有100μgml氨苄西林抗性的LB琼脂平板,过夜培养,挑取单克隆菌落用于菌液PCR、酶切和测序验证,Zophobasatratus防御素和信号肽融合基因的测序结果如SEQIDNO:13-17所示;步骤二构建基因工程菌的具体步骤如下:1挑取宿主菌WB600的单菌落接种至2mlSP-I培养基中,置于50ml离心管,37℃、200rpm过夜培养;2取过夜培养菌液100μl接种至5mlSP-I培养基,37℃、200rpm培养至菌液OD600在0.6-0.8之间;3取200μl步骤2中菌液接种至2mlSP-Ⅱ培养基,37℃、100rpm培养90min;4加入20μl100×EGTA溶液,继续培养10min,然后500μl分装,置于1.5ml离心管;5每管中加入1μg重组质粒PMA5、PMA5-SPn-ZD,37℃,100rpm,30min后调整转速至200rpm,继续培养2.5h;6将菌液8000g,5min离心后弃去400μl上清,剩余上清重悬菌体,用涂布棒涂布至含50μgml卡那霉素的LB琼脂平板,过夜培养;7重组菌株PCR鉴定:挑取上述基因工程菌单个菌落接种至800μl含25μgml氯霉素的LB液体培养基,37℃,200rpm摇床培养8h,随后进行菌液PCR验证,获得重组菌株WB600-PMA5、WB600-PMA5-SPn-ZD;步骤三诱导表达和产物鉴定的具体步骤如下:1分别挑取重组菌株WB600-PMA5,WB600-PMA5-SPn-ZD单个菌落接种至5ml含50μgml卡那霉素的LB液体培养基37℃,200rpm过夜培养,所得菌液作为发酵种子液;2吸取25μl种子液接种至25ml含50μgml卡那霉素的2×SR液体培养基,37℃,180rpm摇床培养24h;38000g,5min离心收集上清,用于表达产物鉴定;4取1.35ml菌液上清,添加150μl100%三氯乙酸混匀,4℃过夜沉淀蛋白;515000g,15min,4℃离心步骤4所述产物,弃去上清,收集沉淀;6使用预冷的丙酮重悬洗涤5中所得沉淀,15000g,15min,4℃离心,弃去上清,通风干燥至丙酮完全挥发;7在步骤6中所得沉淀加入40μl1×Tricine上样缓冲液,沸水水浴10min,所得产物用于Tris-tricine电泳和考马斯亮兰染色;其中,步骤一重组表达载体的构建中,扩增信号肽基因所用的引物序列如下:bpr-F:5’-aaagtgaaatcagggggatccATGAGGAAAAAAACGAAAAACAGAC-3’bPR-R:5’-tctggtacgtaccaagctagcTTAACGGCAAACGCATACAGAT-3’dacB-F:5’-aaagtgaaatcagggggatccATGCGCATTTTCAAAAAAGCA-3’dacB-R:5’-tctggtacgtaccaagctagcTTAACGGCAAACGCATACAGAT-3’eapD-F:5’-aaagtgaaatcagggggatccATGAAAAAGCTTTTGACTGTCATGA-3’eapD-R:5’-tctggtacgtaccaagctagcTTAACGGCAAACGCATACAGAT-3’lytE-F:5’-aaagtgaaatcagggggatccATGAAAAAGCAAATCATTACAGCTACG-3’lyte-R:5’tctggtacgtaccaagctagcTTAACGGCAAACGCATACAGAT-3’wapA-F:5’-aaagtgaaatcagggggatccATGAAAAAAAGAAAGAGGCGAAAC-3’wapA-R:5’-tctggtacgtaccaagctagcTTAACGGCAAACGCATACAGAT-3’;其中,步骤一重组表达载体的构建中,扩增抗菌肽基因所用的引物序列如下:bpr-BamhI-ZD-F:5’-aCACCACCATCACCACCACTTC-3’bpr-BamhI-ZD-R:5’-tctggtacgtaccaagctagcTTAACGGCAAACGCATACAGAT-3’dacB-BamhI-ZD-F:5’-atacagcacatgctCACCACCATCACCACCACTT-3’dacB-BamhI-ZD-R:5’-tctggtacgtaccaagctagcTTAACGGCAAACGCATACAGAT-3’eapD-BamhI-ZD-F:5’-gcacagagtCACCACCATCACCACCACTTC-3’eapD-BamhI-ZD-R:5’-tctggtacgtaccaagctagcTTAACGGCAAACGCATACAGAT-3’lytE-BamhI-ZD-F:5’-gcatctgcaCACCACCATCACCACCACTTC-3’lytE-BamhI-ZD-R:5’-tctggtacgtaccaagctagcTTAACGGCAAACGCATACAGAT-3’wapA-BamhI-ZD-F:5’-tttcattagtgccagccCACCACCATCACCACCACTTC-3’wapA-BamhI-ZD-R:5’-tctggtacgtaccaagctagcTTAACGGCAAACGCATACAGAT-3’。
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