龙图腾网&IPTOP
- 微信扫码登录
- 账号密码登录
- 短信登录/注册
买专利卖专利找龙图腾，真高效！ 查专利查商标用IPTOP,全免费！专利年费监控用IP管家,真方便！
申请/专利权人：烟台大学
摘要：本发明涉及基因序列比对技术领域，具体为一种基因组长序列的比对方法、系统、设备和存储介质；为解决现有技术中比对方法准确度较差的问题，本发明首先分别对参考基因组序列和查询序列进行加权syncmer采样处理；然后，明确采样k‑mer序列中seq序列分别在查询序列和参考基因组索引中的开始位置和结束位置，提供准确的位置比对区间；接着，将基于查询结束位置和参考结束位置形成的候选位置集进行成链法处理，得到比对基因序列位置链，反映出基因区域比对结果变化情况；最后，根据需求输出不同对比结果；该方法运用在基因组长序列比对上，能够提高比对准确度、效率和灵活性。
主权项：1.一种基因组长序列的比对方法，其特征在于，包括如下操作：S1、参考基因组序列经加权syncmer采样处理，得到若干个第一采样k-mer序列；若干个第一采样k-mer序列与在参考基因组序列中的对应位置，经哈希值转化处理，得到参考基因组索引；S2、查询序列经加权syncmer采样处理，得到若干个第二采样k-mer序列；将第二采样k-mer序列中，seq序列在查询序列的位置，作为查询开始位置；将查询开始位置与k-mer序列长度的和，作为查询结束位置；将seq序列在参考基因组索引的位置，作为参考开始位置；将参考开始位置与k-mer序列长度的和，作为参考结束位置；所有查询结束位置和对应参考结束位置，以及k-mer序列长度，形成了候选位置集；S3、所述候选位置集经成链法处理，得到比对基因序列位置链；S4、基于比对基因序列位置链与查询开始位置、查询结束位置、参考开始位置、参考结束位置，得到基因组长序列比对结果。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 烟台大学 一种基因组长序列的比对方法、系统、设备和存储介质
免责声明
1、本报告根据公开、合法渠道获得相关数据和信息，力求客观、公正，但并不保证数据的最终完整性和准确性。
2、报告中的分析和结论仅反映本公司于发布本报告当日的职业理解，仅供参考使用，不能作为本公司承担任何法律责任的依据或者凭证。
主营中国专利交易买卖与专利转让许可,高校科技成果推广与科技成果转化,知识产权运营管理与平台开发,科技人才专家库与科技猎头等科技服务
开放平台
担保交易
惠及多方
会员特惠
专属平台
适合多方
数据共享
功能齐全
皖公网安备 34010402703815号