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申请/专利权人:新疆畜牧科学院畜牧研究所
摘要:本发明涉及生物技术领域,具体涉及一种用于柯尔克孜羊快速鉴定的SNP位点组合及其应用。本发明提供一种用于柯尔克孜羊快速鉴定的SNP位点组合,包括二十三个SNP位点。本发明从大量群体SNP位点中筛选得到适用于柯尔克孜羊快速鉴定的SNP特征位点组合。应用这些SNP特征位点组合可将柯尔克孜羊从15个绵羊品种中鉴别出来。
主权项:1.一种用于柯尔克孜羊快速鉴定的SNP位点组合,其特征在于,所述SNP位点组合包括:第一SNP位点,所述第一SNP位点为:位于柯尔克孜羊1号染色体11367523位置的碱基T或G;位于柯尔克孜羊1号染色体64320519位置的碱基T或A;位于柯尔克孜羊1号染色体94190341位置的碱基A或G;位于柯尔克孜羊1号染色体94295004位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊1号染色体94382219位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊1号染色体94521008位置的碱基T或C;位于柯尔克孜羊1号染色体95674233位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊1号染色体96023024位置的碱基A或T;位于柯尔克孜羊1号染色体116069691位置的碱基C或A;位于柯尔克孜羊1号染色体184078028位置的碱基G或C;位于柯尔克孜羊1号染色体219333599位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊1号染色体219474875位置的碱基T或C;和位于柯尔克孜羊1号染色体238559259位置的碱基C或A;第二SNP位点,所述第二SNP位点为:位于柯尔克孜羊2号染色体24302009位置的碱基A或G;位于柯尔克孜羊2号染色体26925360位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊2号染色体81662068位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊2号染色体81786646位置的碱基A或C;位于柯尔克孜羊2号染色体141379998位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊2号染色体218534964位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊2号染色体219751991位置的碱基C或G;位于柯尔克孜羊2号染色体220045750位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊2号染色体220104342位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊2号染色体220418100位置的碱基G或T;位于柯尔克孜羊2号染色体220495121位置的碱基C或G;位于柯尔克孜羊2号染色体220525202位置的碱基A或G;位于柯尔克孜羊2号染色体220617096位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊2号染色体220671300位置的碱基A或G;位于柯尔克孜羊2号染色体220819133位置的碱基T或A;位于柯尔克孜羊2号染色体220979492位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊2号染色体221051103位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊2号染色体221226563位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊2号染色体221442443位置的碱基G或C;位于柯尔克孜羊2号染色体221490440位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊2号染色体221535980位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊2号染色体221571096位置的碱基C或A;位于柯尔克孜羊2号染色体222024774位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊2号染色体222179317位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊2号染色体222483719位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊2号染色体222526904位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊2号染色体222551213位置的碱基A或G;位于柯尔克孜羊2号染色体223542577位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊2号染色体223599943位置的碱基C或T;和位于柯尔克孜羊2号染色体232054709位置的碱基G或A;第三SNP位点,所述第三SNP位点为:位于柯尔克孜羊3号染色体71869469位置的碱基C或G;位于柯尔克孜羊3号染色体81311435位置的碱基T或C;位于柯尔克孜羊3号染色体83350539位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊3号染色体93201583位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊3号染色体93270940位置的碱基C或G;位于柯尔克孜羊3号染色体93594487位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊3号染色体156340740位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊3号染色体157413507位置的碱基C或A;位于柯尔克孜羊3号染色体157507828位置的碱基A或G;位于柯尔克孜羊3号染色体162717308位置的碱基T或C;位于柯尔克孜羊3号染色体191470056位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊3号染色体221428102位置的碱基G或A;和位于柯尔克孜羊3号染色体221468358位置的碱基G或A;第四SNP位点,所述第四SNP位点为:位于柯尔克孜羊4号染色体17682487位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊4号染色体17689387位置的碱基G或C;位于柯尔克孜羊4号染色体17738504位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊4号染色体17756002位置的碱基A或G;位于柯尔克孜羊4号染色体21032421位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊4号染色体21126893位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊4号染色体22463607位置的碱基T或C;位于柯尔克孜羊4号染色体45970212位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊4号染色体48849232位置的碱基A或C;位于柯尔克孜羊4号染色体49438944位置的碱基T或G;位于柯尔克孜羊4号染色体51026548位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊4号染色体51783712位置的碱基A或G;位于柯尔克孜羊4号染色体73183156位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊4号染色体73517401位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊4号染色体73631575位置的碱基T或G;位于柯尔克孜羊4号染色体73997768位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊4号染色体74709033位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊4号染色体92240639位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊4号染色体92491717位置的碱基C或A;位于柯尔克孜羊4号染色体93478289位置的碱基T或G;和位于柯尔克孜羊4号染色体102503187位置的碱基G或C;第五SNP位点,所述第五SNP位点为:位于柯尔克孜羊5号染色体11752725位置的碱基A或G;位于柯尔克孜羊5号染色体11793509位置的碱基T或C;位于柯尔克孜羊5号染色体62163453位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊5号染色体103064120位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊5号染色体103205520位置的碱基G或T;和位于柯尔克孜羊5号染色体103270139位置的碱基C或T;第六SNP位点,所述第六SNP位点为:位于柯尔克孜羊6号染色体30361889位置的碱基T或C;位于柯尔克孜羊6号染色体30522846位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊6号染色体34547540位置的碱基C或G;位于柯尔克孜羊6号染色体58529279位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊6号染色体59270921位置的碱基A或G;位于柯尔克孜羊6号染色体60066502位置的碱基T或C;位于柯尔克孜羊6号染色体97591142位置的碱基C或G;和位于柯尔克孜羊6号染色体107942244位置的碱基C或G;第七SNP位点,所述第七SNP位点为:位于柯尔克孜羊7号染色体72282597位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊7号染色体88378943位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊7号染色体100944496位置的碱基C或A;位于柯尔克孜羊7号染色体101176165位置的碱基G或T;和位于柯尔克孜羊7号染色体101221135位置的碱基G或A;第八SNP位点,所述第八SNP位点为:位于柯尔克孜羊8号染色体2225207位置的碱基C或T;第九SNP位点,所述第九SNP位点为:位于柯尔克孜羊9号染色体47257693位置的碱基T或A;位于柯尔克孜羊9号染色体61994866位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊9号染色体76826218位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊9号染色体76901890位置的碱基T或C;位于柯尔克孜羊9号染色体76944232位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊9号染色体80032173位置的碱基C或T;和位于柯尔克孜羊9号染色体80151420位置的碱基C或A;第十SNP位点,所述第十SNP位点为:位于柯尔克孜羊10号染色体23377568位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊10号染色体23567537位置的碱基A或C;位于柯尔克孜羊10号染色体23705812位置的碱基G或C;位于柯尔克孜羊10号染色体64872429位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊10号染色体68761574位置的碱基T或C;位于柯尔克孜羊10号染色体68859836位置的碱基A或G;位于柯尔克孜羊10号染色体68870823位置的碱基T或C;位于柯尔克孜羊10号染色体69131803位置的碱基T或C;位于柯尔克孜羊10号染色体69686682位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊10号染色体69935861位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊10号染色体70203702位置的碱基A或C;位于柯尔克孜羊10号染色体70633553位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊10号染色体70826708位置的碱基A或T;位于柯尔克孜羊10号染色体71201052位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊10号染色体71262603位置的碱基T或G;位于柯尔克孜羊10号染色体72006596位置的碱基T或A;和位于柯尔克孜羊10号染色体73444513位置的碱基G或A;第十一SNP位点,所述第十一SNP位点为:位于柯尔克孜羊11号染色体13526055位置的碱基G或A;第十二SNP位点,所述第十二SNP位点为:位于柯尔克孜羊12号染色体24910127位置的碱基G或C;位于柯尔克孜羊12号染色体26805824位置的碱基A或G;位于柯尔克孜羊12号染色体26889436位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊12号染色体27124783位置的碱基T或A;位于柯尔克孜羊12号染色体29623363位置的碱基T或C;位于柯尔克孜羊12号染色体44163022位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊12号染色体63280399位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊12号染色体63323209位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊12号染色体63332850位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊12号染色体63371231位置的碱基T或G;位于柯尔克孜羊12号染色体63449966位置的碱基A或G;位于柯尔克孜羊12号染色体63829543位置的碱基G或T;位于柯尔克孜羊12号染色体63845667位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊12号染色体63952763位置的碱基T或A;位于柯尔克孜羊12号染色体65107835位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊12号染色体65127247位置的碱基C或A;位于柯尔克孜羊12号染色体65147088位置的碱基A或T;位于柯尔克孜羊12号染色体65417783位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊12号染色体65614981位置的碱基A或G;位于柯尔克孜羊12号染色体66145791位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊12号染色体66178598位置的碱基C或G;位于柯尔克孜羊12号染色体66649764位置的碱基A或C;位于柯尔克孜羊12号染色体66912255位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊12号染色体67200903位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊12号染色体67203870位置的碱基C或A;位于柯尔克孜羊12号染色体74573491位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊12号染色体76932861位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊12号染色体76985673位置的碱基C或T;和位于柯尔克孜羊12号染色体78241158位置的碱基C或T;第十三SNP位点,所述第十三SNP位点为:位于柯尔克孜羊14号染色体310756位置的碱基G或A;和位于柯尔克孜羊14号染色体634148位置的碱基T或C;第十四SNP位点,所述第十四SNP位点为:位于柯尔克孜羊15号染色体59262396位置的碱基G或C;位于柯尔克孜羊15号染色体59673136位置的碱基C或T;和位于柯尔克孜羊15号染色体74238154位置的碱基G或T;第十五SNP位点,所述第十五SNP位点为:位于柯尔克孜羊16号染色体9186278位置的碱基G或C;位于柯尔克孜羊16号染色体22866764位置的碱基T或C;和位于柯尔克孜羊16号染色体33901879位置的碱基G或A;第十六SNP位点,所述第十六SNP位点为:位于柯尔克孜羊18号染色体8492313位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊18号染色体8637737位置的碱基T或A;位于柯尔克孜羊18号染色体8668664位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊18号染色体10661397位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊18号染色体32082951位置的碱基A或G;位于柯尔克孜羊18号染色体32153836位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊18号染色体32337944位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊18号染色体33652519位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊18号染色体35601138位置的碱基A或T;位于柯尔克孜羊18号染色体35777265位置的碱基A或T;位于柯尔克孜羊18号染色体37086917位置的碱基G或A;和位于柯尔克孜羊18号染色体37412421位置的碱基G或C;第十七SNP位点,所述第十七SNP位点为:位于柯尔克孜羊19号染色体12707647位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊19号染色体39454481位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊19号染色体39716520位置的碱基T或C;位于柯尔克孜羊19号染色体47719321位置的碱基T或C;位于柯尔克孜羊19号染色体48141087位置的碱基A或T;和位于柯尔克孜羊19号染色体48299849位置的碱基C或T;第十八SNP位点,所述第十八SNP位点为:位于柯尔克孜羊20号染色体37045174位置的碱基T或G;第十九SNP位点,所述第十九SNP位点为:位于柯尔克孜羊21号染色体7745526位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊21号染色体16936003位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊21号染色体35362585位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊21号染色体35390329位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊21号染色体35420429位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊21号染色体35424986位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊21号染色体35752098位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊21号染色体36216478位置的碱基T或C;和位于柯尔克孜羊21号染色体36449148位置的碱基T或C;第二十SNP位点,所述第二十SNP位点为:位于柯尔克孜羊22号染色体6380651位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊22号染色体6479354位置的碱基G或T;位于柯尔克孜羊22号染色体7390828位置的碱基A或G;位于柯尔克孜羊22号染色体7392522位置的碱基T或A;位于柯尔克孜羊22号染色体7500620位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊22号染色体7564969位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊22号染色体7603667位置的碱基A或G;位于柯尔克孜羊22号染色体7831773位置的碱基C或T;和位于柯尔克孜羊22号染色体27016165位置的碱基T或C;第二十一SNP位点,所述第二十一SNP位点为:位于柯尔克孜羊23号染色体9020890位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊23号染色体22159250位置的碱基G或A;和位于柯尔克孜羊23号染色体22644433位置的碱基C或A;第二十二SNP位点,所述第二十二SNP位点为:位于柯尔克孜羊24号染色体4832642位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊24号染色体12670798位置的碱基A或C;位于柯尔克孜羊24号染色体16229995位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊24号染色体23073979位置的碱基G或C;位于柯尔克孜羊24号染色体23628958位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊24号染色体32673513位置的碱基A或G;位于柯尔克孜羊24号染色体33662389位置的碱基G或T;位于柯尔克孜羊24号染色体34016364位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊24号染色体34060030位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊24号染色体34066651位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊24号染色体34073302位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊24号染色体34086975位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊24号染色体34097427位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊24号染色体34372547位置的碱基C或A;位于柯尔克孜羊24号染色体34410321位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊24号染色体35654699位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊24号染色体35704528位置的碱基G或T;位于柯尔克孜羊24号染色体35957450位置的碱基C或T;和位于柯尔克孜羊24号染色体42045224位置的碱基C或T;第二十三SNP位点,所述第二十三SNP位点为:位于柯尔克孜羊X号染色体254758位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊X号染色体444532位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊X号染色体560527位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊X号染色体1140831位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊X号染色体1323269位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊X号染色体1334287位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊X号染色体1354221位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊X号染色体1507438位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊X号染色体2162607位置的碱基G或T;位于柯尔克孜羊X号染色体3767839位置的碱基T或C;位于柯尔克孜羊X号染色体3919512位置的碱基A或C;位于柯尔克孜羊X号染色体3972026位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊X号染色体4014037位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊X号染色体4066175位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊X号染色体4086240位置的碱基G或T;位于柯尔克孜羊X号染色体4439653位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊X号染色体4718100位置的碱基A或G;位于柯尔克孜羊X号染色体4721628位置的碱基A或G;位于柯尔克孜羊X号染色体4734058位置的碱基G或C;位于柯尔克孜羊X号染色体4798647位置的碱基G或T;位于柯尔克孜羊X号染色体4834755位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊X号染色体4936417位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊X号染色体4971254位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊X号染色体5145445位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊X号染色体5340104位置的碱基T或A;位于柯尔克孜羊X号染色体5741434位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊X号染色体14602342位置的碱基C或T;位于柯尔克孜羊X号染色体16918738位置的碱基C或G;位于柯尔克孜羊X号染色体21815578位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊X号染色体39215219位置的碱基G或A;位于柯尔克孜羊X号染色体56091183位置的碱基C或T;和位于柯尔克孜羊X号染色体132100269位置的碱基G或A。
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