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一种基于强化学习的DQN算法预测药物相互作用的方法 

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申请/专利权人:天津大学合肥创新发展研究院

摘要:本发明一种基于强化学习的DQN算法预测药物相互作用的方法,包括以下步骤:步骤1,构建数据集及对数据预处理,对所述药物分子组合A和B的数据进行相关性分析,步骤2,构建所述基于强化学习的DQN算法表示框架模型,步骤3,构建与步骤2不相关的非强化学习模型框架,并与强化学习的DQN算法框架模型进行比较分析,步骤4,构建基于数据增强生成的强化学习模型,本发明采用强化学习算法结合神经网络的方法‑DQN算法对模型进行训练,进而预测抗艾滋病药物组合中两种药物分子是否具有协同作用,同时与其他非强化学习方法进行比对,进而分析并改善DQN算法的功能,能够指导设计治疗艾滋病的药物组合。

主权项:1.一种基于强化学习的DQN算法预测药物相互作用的方法,其特征在于,包括以下步骤:步骤1,构建数据集及对数据预处理;1-1,数据集中包括两种药物分子组合A和B;1-2,对所述药物分子组合A和B的数据进行归一化、主成分分析降维处理;1-3,对所述药物分子组合A和B进行相关性分析;步骤2,构建所述基于强化学习的DQN算法表示框架模型;步骤3,构建与步骤2不相关的非强化学习模型框架,并与强化学习的DQN算法框架模型进行比较分析;步骤4,构建基于数据增强生成的强化学习模型;4-1,通过小批量药物分子组合A和B生成大量具有不同结构和性质的分子,获取某一字符准确的分布对模型进行训练;4-2,数据增强:采用独热法对SMILES序列进行编码,采集每一个分子不同的SMILES序列10个,作为训练集,采用四层神经网络,第一隐含层神经元个数为1024,第二隐含层神经元个数为256,训练过程中,模型学习每一个字符对于前边所有字符的条件概率分布,最小化产生的分子的字符的分布与真实的分子的字符的分布交叉熵,训练过程中,当生成终止字符或者达到最大长度时停止,采用温度采样的方法进行训练,对SoftMax函数施加温度参数T,按照以下公式计算每一个位置某一个字符的存在概率: 其中,ni为某个位置第i个字符存在的概率,s为打出的分值;按照公式计算最终生成了92个SMILES序列,并提取到54个增强分子;4-3,针对步骤4-2中生成的54个增强分子组合,进行协同作用预测。

全文数据:

权利要求:

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