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申请/专利权人：得克萨斯大学体系董事会
摘要：一种将T细胞受体TCR组库样本变换成固定长度向量的新颖框架。每个TCR中不同长度的短肽序列可以被编码为具有固定维度的数值向量。可以池化来自健康个体的大量现有TCR，以在高维欧几里得空间中生成编码向量的分布。可以对该空间中的“点”每个点都是TCR执行无监督聚类，以将它们分组为特定于抗原的簇。每个簇的质心可以被定义为组库功能单元“RFU”。对于新的TCR组库样本，可以将每个TCR指派到其最相似的RFU组，并且可以通过组库中的序列数对RFU计数进行归一化。输出数据可以是固定长度的RFU向量，每个数字表示组库中给定RFU的相对丰度。
主权项：1.一种方法，包括：将T细胞受体TCR样本的大序列中的TCR的短肽序列编码成具有固定维度的数值向量，所述短肽序列具有不同的长度；将来自健康个体的现有TCR池中的每个TCR变换成数值向量，以生成数值向量在高维欧几里得空间中的分布；将来自现有TCR池的变换后的TCR聚类为特定于抗原的簇，其中每个簇的质心是组库功能单元“RFU”；将一个或多个TCR组库样本中的每个TCR变换成数值向量；基于一个或多个相关性将来自所述一个或多个TCR组库样本中的每个TCR组库样本的一个或多个变换后的TCR指派给RFU；以及将具有来自所述一个或多个TCR组库样本中的每个TCR组库样本的指派的变换后的TCR的RFU的数量通过对应的TCR组库样本中的TCR总数进行归一化，以针对所述一个或多个TCR组库样本中的每个TCR组库样本生成固定长度的RFU向量。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 得克萨斯大学体系董事会 TCR组库功能单元
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