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申请/专利权人：时夕(广州)生物科技有限公司
摘要：本发明属于生物医药领域，更具体地，涉及RNA编辑领域，涉及一种获得ADAR底物候选序列结构的方法。基于本发明的方法获得的ADAR底物候选序列结构可用于设计向导RNA，所设计的向导RNA可能高效招募ADAR蛋白并对特定位点进行编辑。
主权项：1.一种获得ADAR底物候选序列结构的方法，其特征在于，包含如下步骤：S1.基于转录组测序文库，获取编辑位点数据集X，所述编辑位点为A位点被编辑为I碱基的位点；S2.基于基因组序列或测序文库，获取天然双链二级结构数据集Y；S3.基于编辑位点数据集X，获取其中的子集X1，所述子集X1所含的编辑位点为处于天然二级双链结构数据集Y中的位点；S4.获取子集X1中的编辑位点的编辑水平数据集；S5.以编辑水平的高低对所述编辑水平数据集中的数据进行排序获得序位，将排序中编辑水平高的一端的一个或多个序位所对应的编辑位点确定为候选编辑位点，将所述候选编辑位点所对应的其所处的序列片段、及其相应的互补序列片段所形成的二级结构作为ADAR底物候选序列结构。
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权利要求：
百度查询： 时夕(广州)生物科技有限公司 一种获得ADAR底物候选序列结构的方法
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