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申请/专利权人：中国科学院南海海洋研究所
摘要：本发明公开了一种珊瑚共附生古菌多样性的研究方法及检测试剂盒。本发明提供一种NestedPCR或Semi‑nestedPCR研究古菌多样性的方法及检测试剂盒，包括2套引物组、2轮PCR反应体系和扩增流程。本发明用于古菌16SrDNA的V3、V4、V5可变区文库构建、测序及古菌多样性分析；既可同时检测到各门类古菌、又可有效屏蔽包括珊瑚、虫黄藻和各类真核生物、病毒和大部分细菌等影响，获得古菌含量及分类单元等显著增加；可用于底泥、水体等环境样本和各类生物样本，尤其适用于珊瑚、海绵、海葵、钙藻等生物共附生古菌研究。本发明能全面、准确、快速地研究古菌多样性，特异性强、灵敏度高、重复性好，且操作简单、样品保真性高、适用性广。
主权项：1.一种快速检测古菌多样性的引物组，其特征在于，所述引物组包括SeqF1、SeqF2,SeqR1、SeqR2，具体如下所示：SeqF1：5’-GCMCTAYGGKGYGCASCAGK-3’；SeqF2：5’-XXXXXXGYMGCCRCGGKAAHAS-3’；SeqR1：5’-TTCGGRSCRTRCNGACCTRCCG-3’；SeqR2：5’-XXXXXXNYRTACTYCCCARGYRG-3’；“XXXXXX”为Index序列，用于识别各样本16SrDNA序列；其中，简并引物代码分别是N是A,T,C,G；M是A,C；Y是C,T；K是G,T；S是G,C；R是A,G；W是A,T；H是A,T,C；B是G,T,C。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 中国科学院南海海洋研究所 一种珊瑚共附生古菌多样性的研究方法及检测试剂盒
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