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申请/专利权人：南开大学
摘要：本发明公开了用于规模化发现D型蛋白质的质谱方法，包括：获得生物样品的构象分辨蛋白组学数据；将构象分辨蛋白组学数据中的氨基酸序列通过搜索蛋白质数据库生成的数据集进行特征提取，建立蛋白质样本异构修饰检索的特征集；对于同一个氨基酸序列的特征数据，删除保留时间差值小于2分钟和或碰撞横截面积差值小于1.5％的数据，筛选出具有立体异构的蛋白质或多肽，通过计算每一个蛋白质的异构化比例及数量获取初筛结果；利用异构信号放大算法和异构化酶等手段对初筛结果进行异构验证，生成最终的D型蛋白质数据。本发明能够准确地识别蛋白立体异构修饰，提高D型蛋白质规模化识别的可靠性和准确性；快速处理大规模的蛋白质组学数据；具有普适性。
主权项：1.用于规模化发现D型蛋白质的质谱方法，其特征在于，包括：获得生物样品的构象分辨蛋白组学数据，包括同一氨基酸序列的立体异构多肽保留时间信息、串联质谱信息、碰撞横截面积以及立体异构体信号响应强度；将所述构象分辨蛋白组学数据中的氨基酸序列通过搜索蛋白质数据库生成的数据集进行特征提取，得到蛋白质样本的多条特征数据，以建立蛋白质样本异构修饰检索的特征集，每条特征数据均包括蛋白质名称、氨基酸序列、色谱的保留时间、电荷、信号响应强度、质荷比和二级质谱图；对于同一个氨基酸序列下的特征数据，删除保留时间差值小于2分钟和或碰撞横截面积差值小于1.5％的数据，以筛选出具有立体异构的蛋白质或多肽，通过计算每一个蛋白质的异构化比例及数量获取初筛结果；对初筛结果进行异构验证，生成最终的D型蛋白质数据。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 南开大学 用于规模化发现D型蛋白质的质谱方法
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