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长读长基因测序数据的质量评估方法、装置、设备及介质 

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申请/专利权人:深圳市梅丽纳米孔科技有限公司

摘要:本申请涉及一种长读长基因测序数据的质量评估方法、装置、设备及介质,其中方法包括:获取参考序列和测序下机的长读长测序数据;基于碱基序列信息和质量值信息确定每条长读长测序数据的质量数据和数据筛选结果;将长读长测序数据与参考序列进行比对,生成参考基因组比对结果;基于参考基因组比对结果,计算测序准确率,得到测序准确率统计结果;获取比对后的测序数据,将比对后的测序数据与参考序列进行匹配计算和碱基修正,以生成长读长的数据一致性序列;基于所统计结果和一致性序列生成测序结果的质量评估网页报告。本申请实现了对长读长测序数据的自动化、流程化和标准化数据质量评估。

主权项:1.一种长读长基因测序数据的质量评估方法,其特征在于,包括:获取参考序列和测序下机的长读长测序数据,其中,所述长读长测序数据包括碱基序列信息和每个碱基对应的质量值信息;基于所述碱基序列信息和所述质量值信息确定每条所述长读长测序数据的质量数据和数据筛选结果;将所述长读长测序数据与所述参考序列进行比对,生成参考基因组比对结果;基于所述参考基因组比对结果,计算测序准确率,得到测序准确率统计结果;获取比对后的测序数据,将所述比对后的测序数据与所述参考序列进行匹配计算和碱基修正,以生成长读长的数据一致性序列;基于所述质量数据、所述数据筛选结果、所述参考基因组比对结果、所述测序准确率统计结果和所述长读长的数据一致性序列绘制可视化图表,并生成测序结果的质量评估网页报告。

全文数据:

权利要求:

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