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预测扰动对免疫细胞功能影响的方法、装置、设备和介质 

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申请/专利权人:百图生科(北京)智能技术有限公司

摘要:一种预测扰动对细胞功能影响的方法、装置、电子设备和介质。方法包括:获得输入数据;利用扰动效应预测模型处理输入数据,处理输入数据包括:在异构图神经网络中提供从至少一个扰动节点指向一个或多个节点的边,得到加扰动的异构图神经网络;使加扰动的异构图神经网络通过消息传递来更新基因节点相应的特征向量以及蛋白质节点相应的特征向量;以及使多层感知器神经网络执行以下各项中的至少一者:i根据至少一个蛋白质节点的经更新的特征向量生成第一输出数据;ii根据至少一个蛋白质节点的经更新的特征向量生成第二输出数据;和iii根据至少一个基因节点的经更新的特征向量生成第三输出数据。

主权项:1.一种预测扰动对细胞功能影响的方法,包括:获得输入数据,所述输入数据包括至少一个扰动特征向量,所述至少一个扰动特征向量分别表征至少一个扰动;以及利用扰动效应预测模型处理所述输入数据,其中,所述扰动效应预测模型包括异构图神经网络和多层感知器神经网络,所述异构图神经网络包括分别表示至少一个基因的至少一个基因节点、分别表示至少一个蛋白质的至少一个蛋白质节点、以及表示节点间相互作用的边,所述基因节点配置有相应的初始特征向量,所述蛋白质节点配置有相应的初始特征向量,其中,所述输入数据包括被扰动信息,所述被扰动信息表征所述基因节点和所述蛋白质节点中所述至少一个扰动所要施加到的一个或多个节点,所述处理所述输入数据包括:在所述异构图神经网络中提供从至少一个扰动节点指向所述一个或多个节点的边,得到加扰动的异构图神经网络,所述至少一个扰动节点分别对应于所述至少一个扰动并且分别配置有所述至少一个扰动特征向量,所述扰动特征向量至少表征扰动的类型和或强度,所述指向所述一个或多个节点的边表示所述至少一个扰动被施加到所述一个或多个节点;使所述加扰动的异构图神经网络通过消息传递来更新所述基因节点相应的特征向量以及所述蛋白质节点相应的特征向量;以及使所述多层感知器神经网络执行以下各项中的至少一者:i根据至少一个所述蛋白质节点的经更新的特征向量生成第一输出数据,所述第一输出数据是对所述细胞在所述至少一个扰动下功能的预测;ii根据至少一个所述蛋白质节点的经更新的特征向量生成第二输出数据,所述第二输出数据是对所述至少一个扰动对应的至少两个子扰动条件之间协同程度的预测,所述至少两个子扰动条件指向的所述一个或多个节点不同,和或,所述至少两个子扰动条件所对应的扰动节点不同;和iii根据至少一个所述基因节点的经更新的特征向量生成第三输出数据,所述第三输出数据是对至少一个所述基因节点所表示的基因的基因表达量的预测。

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