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基于高斯核条件生成的空间转录组细胞类型识别方法 

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申请/专利权人:西安电子科技大学

摘要:本发明提出了一种基于高斯核条件生成的空间转录组细胞类型识别方法,其实现步骤为:获取待识别细胞类型的空间转录组与单细胞参考集的基因交集;计算待识别细胞类型的空间转录组中细胞类型特异性的基因特征;根据细胞类型特异性的基因特征重建取基因交集后的空间转录组分布;利用高斯核条件生成求解丰度的空间相关性,从重建后的空间转录组分布中识别细胞类型。本发明解决了现有技术缺乏鲁棒性、单细胞无效信息过多、对空间信息挖掘不足等问题,具有出色的抗数据扰动能力,并能充分利用每一维特征,提高了空间转录组细胞类型识别的准确性、计算效率和泛化性能。

主权项:1.一种基于高斯核条件生成的空间转录组细胞类型识别方法,其特征在于,计算待识别细胞类型的空间转录组中细胞类型特异性的基因特征,重建取基因交集后的空间转录组分布,利用高斯核条件生成,从重建后的空间转录组分布中识别细胞类型;该细胞类型识别方法的步骤包括如下:步骤1,获取待识别细胞类型的空间转录组与单细胞参考集的基因交集;步骤2,计算待识别细胞类型的空间转录组中细胞类型特异性的基因特征;步骤3,根据细胞类型特异性的基因特征重建取基因交集后的空间转录组分布;步骤4,利用高斯核条件生成求解丰度的空间相关性,从重建后的空间转录组分布中识别细胞类型。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 西安电子科技大学 基于高斯核条件生成的空间转录组细胞类型识别方法

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