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申请/专利权人：北京大学
摘要：本发明公开了一种基于三代长读长测序的Strand‑seq方法，可以得到较长的DNA片段长度、基因组覆盖度，实现不依赖于父母源SNP信息的染色体级别单倍型分型、结构变异检测，尤其是基因组串联重复区域、复杂区域的结构变异检测和分型，弥补了现有基于短读长测序方法在结构变异长度及基因组检测范围的明显缺陷。利用该方法也可以将遗传突变、结构变异事件、SNP连锁信息与表型和疾病关联，辅助临床医师进行个性化诊断和治疗。因此，本发明具有重要的应用价值。
主权项：1.一种基于三代长读长测序的Strand-seq方法，包括如下步骤：1取来源于二倍体或多倍体的细胞系或血液、组织、分泌物、体液等来源的细胞，利用同步化试剂将细胞同步至G2M期；之后加入核苷酸类似物，经过完整一轮复制，得到单细胞悬液；2完成步骤1后，取所述单细胞悬液，收集细胞沉淀；之后裂解，得到细胞溶液；3完成步骤2后，向所述细胞溶液加入细胞核染料，之后用流式细胞仪分选渗入核苷酸类似物的G1期单细胞，之后充分裂解细胞核，释放基因组，得到充分裂解的DNA底物；4完成步骤3后，将所述充分裂解的DNA底物和Tn5转座复合体共孵育，通过转座反应，对DNA进行酶切的同时接入标签序列，获得长片段的DNA；之后终止反应，将Tn5从DNA上解离；5完成步骤4后，进行链方向性扩增，得到单细胞的PCR扩增产物；之后将不同条形码标记的单细胞的PCR扩增产物混合，得到混合扩增产物；6完成步骤5后，将混合扩增产物进行文库构建和测序。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 北京大学 一种基于三代长读长测序的Strand-seq方法
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