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申请/专利权人：中国农业科学院油料作物研究所
摘要：本发明提供了一种甘蓝型油菜抗裂角指数性状全基因组选择育种方法，包括：获取甘蓝型油菜样本，进行全基因组重测序，将测序数据中的基因型数据进行清洗，并确定参考基因组，针对参考基因组建立索引目录，将清洗后的数据导入GATK软件中进行变异呼叫及过滤筛选，得到有效变异位点，对其进行全基因组关联分析，获得高质量变异位点，将变异位点的数据及甘蓝型油菜的表型数据导入预设的若干机器学习预测模型中，进行模拟预测，得到预测结果，根据预测结果，筛选预测结果精度高的模型，将待预测的甘蓝型油菜样本的数据导入该模型，得到最终的预测结果。本发明提供的甘蓝型油菜抗裂角指数性状全基因组选择育种方法，有效提高了基因组预测的准确性。
主权项：1.一种甘蓝型油菜抗裂角指数性状全基因组选择育种方法，其特征在于，包括如下步骤：步骤1：获取甘蓝型油菜样本；步骤2：对获取的甘蓝型油菜样本进行全基因组重测序，并收集测序数据；步骤3：将测序数据中的基因型数据进行清洗，并确定参考基因组，针对参考基因组建立索引目录；步骤4：将清洗后的数据导入GATK软件中进行变异呼叫及过滤筛选，得到有效变异位点；步骤5：对有效变异位点进行全基因组关联分析，获得高质量变异位点；步骤6：将高质量变异位点的数据及甘蓝型油菜的表型数据导入预设的若干机器学习预测模型中，进行模拟预测，得到预测结果；步骤7：比较各机器学习预测模型的预测结果，筛选预测结果精度高的模型；步骤8：将待预测的甘蓝型油菜样本的高质量变异位点的数据及表型数据导入预测结果精度高的模型，得到最终的预测结果。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 中国农业科学院油料作物研究所 一种甘蓝型油菜抗裂角指数性状全基因组选择育种方法
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