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同时对tRNA及其裂解产生的tsRNA进行定量的高通量测序方法 

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申请/专利权人:湖南大学

摘要:本发明属于高通量测序技术领域,具体涉及一种同时对tRNA及其裂解产生的tsRNA进行定量的高通量测序方法。本发明公开了一种同时对tRNA及其裂解产生的tsRNA进行定量的高通量测序方法,所述高通量测序方法包含以下步骤:1总RNA提取、氧化与β消除;2分离tRNA和tsRNAs;3对tRNA和tsRNAs去甲基化;4对tRNA和tsRNAs去3’磷酸;5对tRNA和tsRNAs连接3’接头序列;6对tRNA和tsRNAs连接5’接头序列后混合;6反转录成cDNA;7PCR扩增;8测序。本发明的方法能同时针对tRNA及其裂解产生的tsRNAs进行测序和准确的定量。

主权项:1.一种同时对tRNA及其裂解产生的tsRNA进行定量的高通量测序方法,其特征在于,所述高通量测序方法包含以下步骤:1总RNA提取、氧化与β消除;2分离tRNA和tsRNAs;3对tRNA和tsRNAs去甲基化;4在步骤3的基础上,对tRNA和tsRNAs去3’磷酸;5在步骤4的基础上,对tRNA和tsRNAs连接3’接头序列;所述tRNA的3’接头序列为:NNGATGCATACAAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAA;其中tsRNA所述的3’接头序列为:NNGATTCTAGCAAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAA;N为随机碱基,A、T、G、C和U中的一种;6在步骤5的基础上,对tRNA和tsRNAs连接5’接头序列后混合;所述3’接头序列为ACACUCUUUCCCUACACGACGCUCUUCCGAUCUNNNN;N为随机碱基,A、T、G、C和U中的一种;6反转录成cDNA;7PCR扩增;8测序。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 湖南大学 同时对tRNA及其裂解产生的tsRNA进行定量的高通量测序方法

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