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一种DNA中8-氧-2’脱氧鸟嘌呤修饰单碱基分辨率定位分析方法 

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申请/专利权人:青岛大学

摘要:本发明公开了一种DNA中8‑氧‑2’脱氧鸟嘌呤修饰单碱基分辨率定位分析方法,属于生物技术领域。首先提取基因组DNA,超声打断,然后变性为单链DNA再用抗体富集含8‑oxo‑dG的单链DNA;再将富集得到的单链DNA加上3’5’通用测序接头;将氨基修饰延伸引物固定至羧基修饰磁珠,得到羧基修饰磁珠固定的延伸引物;通过羧基修饰磁珠固定的延伸引物延伸,DNA聚合酶介导富集的单链DNA中8‑氧‑2’脱氧鸟嘌呤‑胸腺嘧啶转换,得到固定在磁珠的引物延伸产物;纯化固定在磁珠的引物延伸产物;PCR扩增引物延伸产物,并进行酶切或测序分析。上述方法反应体系温和,避免现有化学标记方法中可能人为引入DNA氧化修饰的弊端,通过GT转换,更直接、准确地对8‑oxo‑dG修饰定位分析。

主权项:1.一种DNA中8-氧-2’脱氧鸟嘌呤修饰单碱基分辨率定位分析方法,其特征在于,包括以下步骤:1提取基因组DNA,超声打断至250bp;2变性为单链DNA再用抗体富集含8-oxo-dG的单链DNA;3将富集得到的单链DNA加上3’5’通用测序接头;4将氨基修饰延伸引物固定至羧基修饰磁珠,得到羧基修饰磁珠固定的延伸引物;5通过羧基修饰磁珠固定的延伸引物延伸,DNA聚合酶介导步骤3中富集的单链DNA中8-氧-2’脱氧鸟嘌呤-胸腺嘧啶转换,得到固定在磁珠的引物延伸产物;6纯化固定在磁珠的引物延伸产物;7PCR扩增引物延伸产物,并进行酶切或测序分析。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 青岛大学 一种DNA中8-氧-2’脱氧鸟嘌呤修饰单碱基分辨率定位分析方法

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