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一种多鳞鱚耐低氧性状相关SNP分子标记及其应用 

申请/专利权人:广东海洋大学

申请日:2023-11-09

公开(公告)日:2024-07-05

公开(公告)号:CN117487931B

主分类号:C12Q1/6888

分类号:C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12N15/11;C12N15/54

优先权:

专利状态码:有效-授权

法律状态:2024.07.05#授权;2024.02.23#实质审查的生效;2024.02.02#公开

摘要:本发明公开了一种多鳞鱚耐低氧性状相关SNP分子标记,为以下5个SNP分子标记中的一个或几个,分别位于如SEQIDNO:1所示SsMGST3b基因核苷酸序列自5’端起的第583、611、629、633和937位,第583位碱基为T或C,第611位碱基为A或G,第629位碱基为T或A,第633位碱基为T或A,第937位碱基为A或G,基因型为CT,AG,AT,AT和AA的个体耐低氧能力显著强于其他基因型个体,还公开了用于扩增SNP分子标记的引物和包括所述引物的试剂盒以及利用所述引物检测多鳞鱚耐低氧能力的方法,以及上述SNP分子标记、引物、试剂盒或检测方法在鉴别或选育耐低氧性状多鳞鱚品种中的应用。

主权项:1.一种多鳞鱚耐低氧性状的检测方法,其特征在于包括以下步骤:(S1)提取待测多鳞鱚尾鳍的基因组DNA;(S2)采用用于扩增多鳞鱚耐低氧性状相关SNP分子标记的引物,将待测多鳞鱚尾鳍的基因组DNA进行PCR扩增,获得PCR扩增产物;(S3)对PCR扩增产物进行测序,基于测序结果,确定SNP分子标记的基因型;(S4)通过基因型确定待测多鳞鱚的耐低氧性状;步骤(S2)中所述引物包括正向引物SsMGST3b-F和反向引物SsMGST3b-R,所述正向引物SsMGST3b-F的碱基序列如SEQIDNO:2所示,所述反向引物SsMGST3b-R的碱基序列如SEQIDNO:3所示;步骤(S2)中所述SNP分子标记为以下5个SNP分子标记,所述5个SNP分子标记分别位于如SEQIDNO:1所示SsMGST3b基因核苷酸序列自5,端起的第583、611、629、633和937位,其中第583位的碱基为T或C,第611位的碱基为A或G,第629位的碱基为T或A,第633位的碱基为T或A,第937位的碱基为A或G;步骤(S4)中:第583位SNP分子标记的CT基因型个体的耐低氧性状显著高于TT基因型个体,第611位SNP分子标记的AG基因型个体的耐低氧性状显著高于AA基因型个体,第629位SNP分子标记的AT基因型个体的耐低氧性状显著高于TT基因型个体,第633位SNP分子标记的AT基因型个体的耐低氧性状显著高于TT基因型个体,第937位SNP分子标记的AA基因型个体的耐低氧性状显著高于AG基因型个体。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 广东海洋大学 一种多鳞鱚耐低氧性状相关SNP分子标记及其应用

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