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高覆盖率STLFR 

申请/专利权人:深圳华大智造科技股份有限公司;深圳华大生命科学研究院

申请日:2020-01-29

公开(公告)日:2024-07-05

公开(公告)号:CN113366115B

主分类号:C12Q1/6806

分类号:C12Q1/6806;C12N15/10;C40B50/06

优先权:["20190129 US 62/798,378","20190506 US 62/843,972"]

专利状态码:有效-授权

法律状态:2024.07.05#授权;2022.01.28#实质审查的生效;2021.09.07#公开

摘要:本文描述的是高覆盖率单管长片段读取stLFR技术,其使用并对在共条形码化之前已被扩增的靶DNA片段执行stLFR,这为测序提供了更高的DNA量并增加了测序覆盖率。在一些实施方案中,本申请中描述的高覆盖率stLFR使用两轮stLFR。在一些实施方案中,用转位子使靶DNA片段转位,该转位子具有可用于对序列读段排序的特定位置条形码。

主权项:1.一种用于制备用于对靶核酸进行测序的测序文库的方法,所述方法包括:a提供所述靶核酸的单链DNA环和多个第一珠,其中所述每一个单链DNA环包括衔接子和独特分子标识符UMI的一个或多个副本,其中每个第一珠包含多个第一捕获寡核苷酸,其中每个第一捕获寡核苷酸包含第一条形码,其中固定在相同个体珠上的所有第一捕获寡核苷酸包含相同的第一条形码,并且大多数珠具有不同的第一条形码,b通过滚环扩增来扩增来自a的所述单链DNA环以产生多个单链多联体,所述单链多联体包含单链衔接子片段的至少五个副本,c将所述单链多联体转化为双链或部分双链DNA分子,d将交错的单链断裂引入c中的所述DNA分子,由此生成第一复合物,所述第一复合物各自包含来自c中的所述DNA分子之一的多个第一亚片段,e将所述第一复合物中的所述第一亚片段中的至少一些与固定在多个个体第一珠上的第一捕获寡核苷酸进行关联,其中每个个体第一珠包含多个所述第一捕获寡核苷酸,由此提供条形码化第一亚片段。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 深圳华大智造科技股份有限公司 深圳华大生命科学研究院 高覆盖率STLFR

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