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申请/专利权人：上海采微生物科技有限公司
申请日：2022-12-28
公开（公告）日：2024-06-28
公开（公告）号：CN118262830A
主分类号：G16C20/70
分类号：G16C20/70;G16C20/90;G06N5/04
优先权：
专利状态码：在审-公开
法律状态：2024.06.28#公开
摘要：一种用于代谢物发现的搜索方法，包括训练部分和推理部分，其中，训练部分包括步骤：预设搜索模型、给定最低搜索峰值阈值、构建预设数目的候选化合物集合形成初始全量、给定质谱数据f并对其峰值从高到低进行排序、取未覆盖质谱数据f最高峰值的数据作为搜索模型的输入数据，在初始全量中搜索目标化合物、根据搜索目标化合物与最低搜索峰值阈值的关系，对搜索模型的权重进行修正，得到优化后的搜索模型。推理部分包括步骤：使用优化后的搜索模型在化合物数据库中对质谱数据进行搜索。根据本发明提供的用于代谢物发现的搜索方法，具备权重调节能力，使其搜索结果更准确，效率更高。
主权项：1.一种用于代谢物发现的搜索方法，包括：训练部分S1和推理部分S2，其中，所述训练部分S1包括如下步骤：S1.1预设搜索模型M，所述搜索模型M包括得分函数h及其权重λ；S1.2给定最低搜索峰值阈值p；S1.3构建预设数目的候选化合物集合，形成初始全量C；S1.4给定质谱数据f，对所述质谱数据f的峰值从高到低进行排序；S1.5取未覆盖所述质谱数据f最高峰值的数据作为所述搜索模型M的输入数据，在所述初始全量C中搜索与所述质谱数据f匹配的目标化合物；S1.6根据所述S1.5中搜索到的所述目标化合物与所述最低搜索峰值阈值p的关系，对所述搜索模型M的所述权重λ进行修正，得到优化后的搜索模型M’；所述推理部分S2包括如下步骤：S2.1获取用户上传的质谱数据b，对所述质谱数据b的峰值从高到低进行排序；S2.2取未所述覆盖质谱数据b最高峰值的数据作为所述搜索模型M’的输入数据，在化合物数据库中搜索与所述质谱数据b匹配的目标化合物；S2.3根据所述S2.2中搜索到的所述目标化合物与所述质谱数据b的匹配结果，对搜索结果从优至劣排序，输出最优的化合物搜索结果。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 上海采微生物科技有限公司 一种用于代谢物发现的搜索方法
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