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用于肉瘤融合基因全面筛查的方法以及试剂盒 

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申请/专利权人:苏州精准医疗科技有限公司

摘要:本发明提供了用于肉瘤融合基因全面筛查的方法,其采用锚定多重PCR和二代测序;靶向的诱导基因为:ABL1;ACTB‑t;ALK;BCOR;BCORL1;BRAF;CAMTA1;CARMN;CCNB3;CDX1;CIC;CRTC1;CSF1;DDIT3;EPC1;ETV6;EWSR1;FN1;FOS;FOSB;FOXO1;FUS;GLI1;HMGA2;JAZF1;KANSL1;MBTD1;MEAF6;MIR143HG;MKL2;NCOA2;NCOA3;NR4A3;NTRK1;NTRK2;NTRK3;NUP160;NUTM1;PAX3;PDGFB;PDGFD;PGR;PHF1;PLAG1;PRDM10;PRKCD;ROS1;SS18;SS18L1;STAT6;TAF15;TCF12;TFE3;TFG;TGFBR3;USP6;VGLL2;YAP1;YWHAE,根据本发明使得锚定策略不需要明确的伙伴基因已经融合位点,多重PCR扩增策略则提供了对预定靶点的高灵敏度和特异性,二代测序策略同时一次可以分析多个基因,适合于大规模筛查。

主权项:1.一种用于肉瘤融合基因全面筛查的方法,其特征在于,其采用锚定多重PCR和二代测序;靶向的诱导基因为:ABL1;ACTB-t;ALK;BCOR;BCORL1;BRAF;CAMTA1;CARMN;CCNB3;CDX1;CIC;CRTC1;CSF1;DDIT3;EPC1;ETV6;EWSR1;FN1;FOS;FOSB;FOXO1;FUS;GLI1;HMGA2;JAZF1;KANSL1;MBTD1;MEAF6;MIR143HG;MKL2;NCOA2;NCOA3;NR4A3;NTRK1;NTRK2;NTRK3;NUP160;NUTM1;PAX3;PDGFB;PDGFD;PGR;PHF1;PLAG1;PRDM10;PRKCD;ROS1;SS18;SS18L1;STAT6;TAF15;TCF12;TFE3;TFG;TGFBR3;USP6;VGLL2;YAP1;YWHAE;其包括步骤:1逆转录样品RNA合成、纯化cDNA2进行第一次PCR,进行第二次PCR以及第三次PCR;3DNA文库检测以及二代测序。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 苏州精准医疗科技有限公司 用于肉瘤融合基因全面筛查的方法以及试剂盒

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