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基于全基因组数据开发的松阿扁叶蜂微卫星引物及其应用 

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申请/专利权人:中国林业科学研究院森林生态环境与自然保护研究所(国家林业和草原局世界自然遗产保护研究中心)

摘要:本发明提供了基于全基因组数据开发的松阿扁叶蜂微卫星引物及其应用,涉及全基因组微卫星标记开发技术领域。所述松阿扁叶蜂微卫星引物包括79对。本发明利用高通量测序测得松阿扁叶蜂随机基因组序列,从中分离得到93,876个完美微卫星位点,共有256种重复基序,其中单、二核苷酸位点最为丰富。经QDD3软件设计引物、严格的手动筛选、个体水平的筛选和种群水平的验证,开发得到79对扩增效率高、多态性较好和分辨率高的微卫星标记引物,能够将山东和黑龙江两个种群的个体独立分开。本研究开发的79对微卫星引物,将为松阿扁叶蜂的种群研究提供有效的遗传标记,以揭示其动态演化历史和虫害爆发的遗传机制。

主权项:1.基于全基因组数据开发的松阿扁叶蜂微卫星引物,其特征在于,包括79对微卫星引物对:S1引物对,所述S1引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.1~2所示;S2引物对,所述S2引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.3~4所示;S4引物对,所述S4引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.5~6所示;S5引物对,所述S5引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.7~8所示;S10引物对,所述S10引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.9~10所示;S11引物对,所述S11引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.11~12所示;S16引物对,所述S16引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.13~14所示;S18引物对,所述S18引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.15~16所示;S20引物对,所述S20引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.17~18所示;S21引物对,所述S21引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.19~20所示;S24引物对,所述S24引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.21~22所示;S25引物对,所述S25引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.23~24所示;S27引物对,所述S27引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.25~26所示;S28引物对,所述S28引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.27~28所示;S29引物对,所述S29引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.29~30所示;S30引物对,所述S30引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.31~32所示;S36引物对,所述S36引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.33~34所示;S39引物对,所述S39引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.35~36所示;S41引物对,所述S41引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.37~38所示;S42引物对,所述S42引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.39~40所示;S43引物对,所述S43引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.41~42所示;S47引物对,所述S47引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.43~44所示;S48引物对,所述S48引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.45~46所示;S49引物对,所述S49引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.47~48所示;S50引物对,所述S50引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.49~50所示;S53引物对,所述S53引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.51~52所示;S54引物对,所述S54引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.53~54所示;S55引物对,所述S55引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.55~56所示;S60引物对,所述S60引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.57~58所示;S62引物对,所述S62引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.59~60所示;S63引物对,所述S63引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.61~62所示;S64引物对,所述S64引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.63~64所示;S67引物对,所述S67引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.65~66所示;S74引物对,所述S74引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.67~68所示;S76引物对,所述S76引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.69~70所示;S85引物对,所述S85引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.71~72所示;S90引物对,所述S90引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.73~74所示;S92引物对,所述S92引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.75~76所示;S94引物对,所述S94引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.77~78所示;S98引物对,所述S98引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.79~80所示;S99引物对,所述S99引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.81~82所示;S100引物对,所述S100引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.83~84所示;S101引物对,所述S101引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.85~86所示;S103引物对,所述S103引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.87~88所示;S107引物对,所述S107引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.89~90所示;S110引物对,所述S110引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.91~92所示;S111引物对,所述S111引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.93~94所示;S113引物对,所述S113引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.95~96所示;S114引物对,所述S114引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.97~98所示;S116引物对,所述S116引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.99~100所示;S117引物对,所述S117引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.101~102所示;S123引物对,所述S123引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.103~104所示;S125引物对,所述S125引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.105~106所示;S129引物对,所述S129引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.107~108所示;S132引物对,所述S132引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.109~110所示;S133引物对,所述S133引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.111~112所示;S134引物对,所述S134引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.113~114所示;S135引物对,所述S135引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.115~116所示;S141引物对,所述S141引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.117~118所示;S144引物对,所述S144引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.119~120所示;S148引物对,所述S148引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.121~122所示;S149引物对,所述S149引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.123~124所示;S150引物对,所述S150引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.125~126所示;S159引物对,所述S159引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.127~128所示;S160引物对,所述S160引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.129~130所示;S162引物对,所述S162引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.131~132所示;S164引物对,所述S164引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.133~134所示;S176引物对,所述S176引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.135~136所示;S181引物对,所述S181引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.137~138所示;S185引物对,所述S185引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.139~140所示;S188引物对,所述S188引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.141~142所示;S190引物对,所述S190引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.143~144所示;S196引物对,所述S196引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.145~146所示;S202引物对,所述S202引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.147~148所示;S205引物对,所述S205引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.149~150所示;S206引物对,所述S206引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.151~152所示;S207引物对,所述S207引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.153~154所示;S213引物对,所述S213引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.155~156所示;S214引物对,所述S214引物对的上下游引物的核苷酸序列依次如SEQIDNo.157~158所示。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 中国林业科学研究院森林生态环境与自然保护研究所(国家林业和草原局世界自然遗产保护研究中心) 基于全基因组数据开发的松阿扁叶蜂微卫星引物及其应用

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