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申请/专利权人：武汉大学
摘要：本发明提供一种入组生酮饮食临床研究患者的首选分子分型的构建方法及首选分子分型方法。该构建方法包括如下步骤：1对临床大样本结肠癌转录组数据以及结肠非肿瘤组织基因mRNA的表达信息进行分析；2筛选出糖代谢和酮体代谢重编程相关的靶点分子；3获得所述多例结肠癌组织的基因mRNA表达信息；4通过R语言分析靶点分子表达与预后之间的关系；5将结肠癌患者癌组织分子分型分为三类：预后最差型、中间型及预后最好型；6选取预后最差的糖酵解型‑酮体代谢缺陷型作为入组生酮饮食临床研究患者的首选分子分型。本发明可筛选出其中预后最差型患者，其肿瘤组织对酮体代谢利用较弱，可作为入组生酮饮食临床研究的首选分子分型。
主权项：1.入组生酮饮食临床研究患者的首选分子分型的构建方法，其特征在于，包括如下步骤：1对临床大样本结肠癌转录组数据以及结肠非肿瘤组织基因mRNA的表达信息进行分析；2比较结肠癌组织与结肠非肿瘤组织在糖酵解、氧化磷酸化、酮体代谢相关分子转录水平的差异性，筛选出糖代谢和酮体代谢重编程相关的靶点分子，所述靶点分子包括GLUT1、PFKFB3、OXCT1及ACAT1；3利用GEO数据库获取多例结肠癌患者的临床信息，获得所述多例结肠癌组织的基因mRNA表达信息；4通过R语言分析靶点分子表达与预后之间的关系，确定GLUT1和或PFKFB3高表达为糖酵解型，预后较差；确定GLUT1和PFKFB3低表达为非糖酵解型；确定OXCT1和或ACAT1低表达为酮体代谢缺陷型，预后较差；并确定OXCT1和ACAT1高表达为酮体代谢型；5进一步将糖酵解和酮体代谢相关基因进行组合，通过生存分析将结肠癌患者癌组织分子分型分为三类：预后最差的为糖酵解型-酮体代谢缺陷型；中间型为非糖酵解型-酮体代谢缺陷型和糖酵解型-酮体代谢型；预后最好的为非糖酵解型-酮体代谢型；6选取预后最差的糖酵解型-酮体代谢缺陷型作为入组生酮饮食临床研究患者的首选分子分型。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 武汉大学 入组生酮饮食临床研究患者的首选分子分型的构建方法
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