恭喜上海元码智药生物技术有限公司赵荟获国家专利权
买专利卖专利找龙图腾,真高效! 查专利查商标用IPTOP,全免费!专利年费监控用IP管家,真方便!
龙图腾网恭喜上海元码智药生物技术有限公司申请的专利三维RNA结构逆折叠的双曲离散扩散模型的构建方法和装置获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119339781B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-04-11发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202411898962.3,技术领域涉及:G16B15/10;该发明授权三维RNA结构逆折叠的双曲离散扩散模型的构建方法和装置是由赵荟;张帅设计研发完成,并于2024-12-23向国家知识产权局提交的专利申请。
本三维RNA结构逆折叠的双曲离散扩散模型的构建方法和装置在说明书摘要公布了:本申请公开了一种三维RNA结构逆折叠的双曲离散扩散模型的构建方法,所述方法通过将RNA三维结构丰富的几何特征和其他拓扑性质嵌入到双曲空间中,利用正向扩散过程对RNA三维结构的真实一维序列进行加逐步噪声以及双曲等变图神经网络去噪模型进行逐步去噪声,在有限的训练样本基础上,有效地恢复出目标RNA三维结构的核苷酸分布,即一维序列,该方法通过双曲等变图神经网络去噪模型来表示RNA的层次结构,并增强了三维反折叠的结构相似性度量。本发明为功能性RNA结构的生成式设计提供了一种强大的人工智能方法,将有助于RNA药物和RNA生物分子的设计及其在生物医药中的应用。
本发明授权三维RNA结构逆折叠的双曲离散扩散模型的构建方法和装置在权利要求书中公布了:1.一种三维RNA结构逆折叠的双曲离散扩散模型的构建方法,其特征在于,包括以下步骤:(a)获取RNA的三维结构以及其真实一维序列,通过图结构抽象表示所述RNA三维结构,所述图结构包括所述RNA三维结构的节点特征和边特征;(b)对所述RNA三维结构的真实一维序列进行正向扩散过程,在所述正向扩散过程中,将噪音迭代地添加到所述RNA三维结构的真实一维序列中,直到所述真实一维序列的核苷酸序列AUGC的概率分布被均匀化,输出具有均匀概率分布的噪声核苷酸序列,其中在每个时间步下添加噪音时,计算出每个时间步下的转移概率;(c)从所述噪声核苷酸序列随机采样,得到随机噪声核苷酸序列;(d)将所述RNA三维结构的边特征输入至多层感知器,获得边嵌入;(e)通过双曲空间模型,获得包括所述RNA三维结构的节点特征和所述随机噪声核苷酸序列的节点特征的组合节点特征的双曲嵌入;(f)将所述组合节点特征的双曲嵌入和所述边嵌入输入至双曲等变图神经去噪网络模型中,对所述双曲等变图神经网络去噪模型进行训练,在所述双曲等变图神经去噪网络模型中,对所述组合节点特征进行更新,基于更新的组合节点特征获得中间核苷酸序列的预测概率分布;基于获得的所述中间核苷酸序列的预测概率分布和所述步骤(b)得到的对应时间步下的转移概率,获得中间核苷酸序列的条件概率分布,从而完成一次去噪过程;(g)从所述中间核苷酸序列的概率分布中采用出中间的RNA一维序列;(h)迭代步骤(e)-(g)多次,在迭代时,将所述步骤(g)中获得的中间的RNA一维序列替换步骤(e)中的所述随机噪声核苷酸序列,在迭代完成后,从去噪完成的核苷酸序列的概率分布采样得到最佳RNA一维序列。
如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人上海元码智药生物技术有限公司,其通讯地址为:201203 上海市浦东新区中国(上海)自由贸易试验区张衡路1077号2幢1层A1022室;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。
1、本报告根据公开、合法渠道获得相关数据和信息,力求客观、公正,但并不保证数据的最终完整性和准确性。
2、报告中的分析和结论仅反映本公司于发布本报告当日的职业理解,仅供参考使用,不能作为本公司承担任何法律责任的依据或者凭证。