恭喜中南大学李敏获国家专利权
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龙图腾网恭喜中南大学申请的专利基于多尺度模块核的致病基因识别方法及系统获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN114242160B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-03-25发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202111575178.5,技术领域涉及:G16B5/20;该发明授权基于多尺度模块核的致病基因识别方法及系统是由李敏;项炬设计研发完成,并于2021-12-21向国家知识产权局提交的专利申请。
本基于多尺度模块核的致病基因识别方法及系统在说明书摘要公布了:本公开实施例中提供了一种基于多尺度模块核的致病基因识别方法及系统,属于生物信息学技术领域,具体包括:通过指数抽样的多尺度模块度优化算法从综合的蛋白质相互作用组提取网络多尺度模块,得到标准化多尺度模块谱;根据标准化多尺度模块谱构建多尺度模块核矩阵并进行核稀疏;提取两个预测列表;融合两个预测列表得到基因概率列表,并根据基因概率列表预测疾病的致病基因。通过本公开的方案,提取多尺度模块谱并标准化,有效融合不同层次、特异性的网络模块结构信息后进行稀疏化,提供了新的基因‑基因关联,然后来自原始异构网络和结合多尺度模块核的异构网络的预测列表的排位聚合有效融合了互补的预测信息,提高了预测效率和预测精准度。
本发明授权基于多尺度模块核的致病基因识别方法及系统在权利要求书中公布了:1.一种基于多尺度模块核的致病基因识别方法,其特征在于,包括:通过指数抽样的多尺度模块度优化算法从综合的蛋白质相互作用组提取网络多尺度模块,构建包含网络局部信息和全局信息的初始多尺度模块谱,并采用特征信息量方法对其进行权重化处理,得到标准化多尺度模块谱,其中,所述网络多尺度模块的公式为其中,ess表示模块s内的边比例,as表示在随机模型中模块s内的边比例,γ为分辨率参数,通过指数抽样方式获得对应不同尺度的γ分辨率参数值;所述标准化多尺度模块谱:B=B1,B2,…,Bh,…,其中,Bh是每个尺度的模块划分矩阵,该矩阵的元素表示基因i是否属于模块s;所述权重化处理的公式为其中,对角矩阵DIC的对角元素DICss=-log∑iIBisN,Ix表示计数函数,N表示节点数目;根据所述标准化多尺度模块谱构建多尺度模块核矩阵并进行核稀疏,得到稀疏矩阵;根据所述蛋白质相互作用组、疾病-疾病关联和疾病-基因关联,以及,根据所述稀疏矩阵、所述疾病-疾病关联和所述疾病-基因关联,分别构建两个概率矩阵,并通过游走动力学过程从两个所述概率矩阵中提取两个预测列表;通过基于节点排位聚合的概率模型融合两个所述预测列表,得到基因概率列表,并根据所述基因概率列表预测疾病的致病基因。
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