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龙图腾网恭喜上海欧易生物医学科技有限公司申请的专利快速批量可自动下载高通量测序数据的方法、系统及应用获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN117894381B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-03-21发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202410049142.0，技术领域涉及：G16B50/00；该发明授权快速批量可自动下载高通量测序数据的方法、系统及应用是由孙同心;张志康;徐天生;陆瑶;肖云平设计研发完成，并于2024-01-12向国家知识产权局提交的专利申请。

本快速批量可自动下载高通量测序数据的方法、系统及应用在说明书摘要公布了：本发明公开了一种快速批量可自动下载高通量测序数据的方法，所述方法基于snakemake语言和MySQL数据库，具体包括如下步骤：流程触发；抓取流程中的样本信息；上传样本信息至MySQL数据库；自动下载数据库中标记为wait的样本；修改数据库中下载开始后的样本状态；下载完毕后将样本信息同步至MySQL数据库；修改下载完成的样本在数据库状态；发送下载的汇总邮件；删除已完工项目的样本数据。本发明所述方法能够对样本进行批量信息同步以及下载，整个过程无需人为介入，能够自动触发中间的各个环节。处理过程中会自动将样本数据的下载汇总信息及时发送给监控人，保证所有操作步骤可溯源，并且借助MySQL数据库方便各类信息查询。本发明还公开了实现上述方法的系统以及应用。

本发明授权快速批量可自动下载高通量测序数据的方法、系统及应用在权利要求书中公布了：1.一种基于snakemake语言和MySQL数据库快速批量可自动下载高通量测序数据的方法，其特征在于，所述方法具体包括如下步骤：步骤一、第一次启动python脚本立即检索第一次启动开始时间至前4个小时内流程中录入样本下机数据库中的下机样本信息，同时记录第一次启动开始时间t0；步骤二、使用python脚本抓取步骤一中获得的下机样本信息，将所述下机样本信息实例化为项目，以项目为单位，获取对应的项目类型，多个节点实时的cpu及mem信息，判断后续进行下载分析的节点路径；步骤三、将步骤二中抓取的样本信息整理成固定表格的形式，使用python连接MySQL数据库，并将整理好的样本信息以表格的形式上传到MySQL数据库中，并标记下载状态为等待下载wait；步骤四、预设的自动下载任务以固定时间间隔扫描一次数据库，当扫描到MySQL数据库中的样本信息为wait时，则自动触发该样本的自动下载；步骤四中，下载任务的自动触发通过python脚本实现；所述固定时间间隔为30min；步骤四中，根据样本下机信息中的下载路径生成对应的下载命令，更新至数据库，通过Snakemake流程投递命令行，使用镜像实现同时调用不同的下载工具并行下载样本；所述镜像是指传输数据软件和进行数据预处理拆分后的多个不同的下载命令运行python环境；步骤五、在触发样本下载的同时python脚本将数据库中已触发下载的样本的下载状态修改为run；步骤六、样本的高通量测序数据下载任务完成后python脚本连接MySQL数据库并将该样本的下载状态改为done，并等待触发后续的分析；步骤七、当流程中的所有样本都下载完成后，python脚本自动的将本次样本下载的状态汇总邮件发给任务监控人；步骤八、一次步骤二至步骤七的循环结束后，暂停30秒启动下一次循环，下一循环的起始时间为tn，读取上一次的启动开始时间tn-1，查询tn-1至tn时间内录入样本下机数据库中的下机样本信息，若该时间段无新录入信息，则不记录tn，若该时间段内有新录入数据，则更新tn-1为tn。

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