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一种分割土壤CT图像中生物性孔隙的方法 

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申请/专利权人:中国科学院南京土壤研究所

摘要:本发明公开了一种分割土壤CT图像中生物性孔隙的方法,包括:对土壤样品进行CT扫描并进行图像预处理;利用Fiji软件中“Purify”插件分别得到每张预处理过图像的最大孔隙网络和孤立孔隙,分别从最大孔隙网络和孤立孔隙中分割出粗生物性孔隙;使用Tubeness检测孤立孔隙中的细生物性孔隙;分离细生物孔隙;将粗生物性孔隙和细生物性孔隙叠加在一起,并将其命名为生物性孔隙;计算生物性孔隙相关特征参数。本发明结合Fiji软件、距离变换分水岭算法和Tubeness滤波器,结合了多种图像处理算法的优势,准确分割出了粗生物孔隙和细生物孔隙,解决了现有技术由于生物性孔隙与其他形态复杂多样的裂缝等非生物性孔隙相连,难以将其准确分割出来的问题。

主权项:1.一种分割土壤CT图像中生物性孔隙的方法,其特征在于,包括以下步骤:步骤S1:对土壤样品进行CT扫描并进行图像预处理,采用全局阈值分割法将图像进行二值化,得到孔隙图像;步骤S2:对每张经步骤S1预处理过的图像,利用Fiji软件中Purify插件得到最大孔隙网络,从最大孔隙网络中分割出粗生物性孔隙;步骤S3:用步骤S1的孔隙图像减去步骤S2的最大孔隙网络,得到孤立孔隙,使用Tubeness检测孤立孔隙中的细生物性孔隙;步骤S4:分离步骤S3的细生物性孔隙;步骤S5:利用Fiji-Process-Imagecalculator-Add算法将步骤S2的粗生物性孔隙和步骤S4的细生物性孔隙叠加在一起,并将其命名为生物性孔隙;步骤S6:计算步骤S5的生物性孔隙相关特征参数。

全文数据:

权利要求:

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