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基于高效特征编码和集成学习的促炎肽识别方法 

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申请/专利权人:海南大学

摘要:本发明公开一种基于高效特征编码和集成学习的促炎肽识别方法,从IEDB数据库中收集人类和小鼠的PIP以及n‑PIP数据并进行数据预处理操作,获得肽序列;对所述肽序列分别进行不同方式的手动特征编码,获得不同维度的特征;将所述不同维度的特征进行整合,获得肽序列编码;基于LightGBM模型和递归式特征消除策略优化所述肽序列编码,获得高效特征;将所述高效特征分别输入若干个基学习器中进行训练并采用硬投票策略对将训练好的若干个基学习器集成,获得最终模型MultiFeatVotPIP;将待检测的肽序列输入最终模型MultiFeatVotPIP中,获得促炎肽识别结果。本发明能够提高促炎肽的识别准确度。

主权项:1.基于高效特征编码和集成学习的促炎肽识别方法,其特征在于,包括如下步骤:从IEDB数据库中收集人类和小鼠的PIP以及n-PIP数据并进行数据预处理操作,获得肽序列;对所述肽序列分别进行不同方式的手动特征编码,获得不同维度的特征;将所述不同维度的特征进行整合,获得肽序列编码;基于LightGBM模型和递归式特征消除策略优化所述肽序列编码,获得高效特征;将所述高效特征分别输入若干个基学习器中进行训练并采用硬投票策略对将训练好的若干个基学习器集成,获得最终模型MultiFeatVotPIP;将待检测的肽序列输入最终模型MultiFeatVotPIP中,获得促炎肽识别结果。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 海南大学 基于高效特征编码和集成学习的促炎肽识别方法

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