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一种测序样本污染的分析方法、装置、系统及存储介质 

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申请/专利权人:广州达安临床检验中心有限公司

摘要:本发明提供了一种测序样本污染的分析方法、装置、系统及存储介质,涉及高通量测序技术领域。所述分析方法包括:确定目标样本的SNP位点及获取每个SNP位点对应的突变频率;根据突变频率对SNP位点进行分类得到位点分型类别及统计个数;确定目标样本中异常位点类别及统计个数;根据统计个数得到污染分析结果。本发明通过在基因检测panel中引入SNP位点,通过异常频率判断疑似污染样本,从而分析样本是否被污染,得到污染分析结果,为高通量测序过程中的样本,一方面为样本污染的分析检测提供了有效途径,另一方面能够更有效地识别和排除假阳性结果,确保高通量测序数据的准确性和实验结果的真实性。

主权项:1.一种测序样本污染的分析方法,其特征在于,包括:确定目标样本的SNP位点,以及获取所述目标样本的每个SNP位点对应的突变频率;根据所述突变频率对所述目标样本的所述SNP位点进行分类,得到每个所述SNP位点对应的位点分型类别,以及每种所述位点分型类别对应的统计个数;其中,所述位点分型类别包括野生型位点、纯合突变型位点和杂合突变型位点;基于所述突变频率,确定所述目标样本中异常位点类别,以及每种所述异常位点类别对应的统计个数;其中,所述异常位点类别包括WT污染位点和Hom污染位点;根据所述位点分型类别和所述异常位点类别对应的统计个数,得到所述SNP位点的污染分析结果。

全文数据:

权利要求:

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