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基于组学-组学核交互的多组学数据整合肿瘤分型方法 

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申请/专利权人:山西医科大学

摘要:本发明属于医疗数据分析技术领域,具体涉及一种基于组学‑组学核交互的多组学数据整合肿瘤分型方法,以提高分型准确性。本方法包括:获取肿瘤患者的多组学数据,所述多组学数据包括但不限制于:mRNA数据、miRNA数据和DNA甲基化数据,对多组学数据进行预处理;对每个组学数据采用高斯核函数计算样本相似核;采用高斯核函数计算每个组学数据集中的样本相似核;采用哈达玛积构建不同组学数据集间的交互核;基于每个组学数据集中的样本相似核与不同组学数据集间的交互核,采用无监督多核学习构建融合核;在融合核基础上进行k‑means聚类,得到肿瘤患者分型结果。

主权项:1.一种基于组学-组学核交互的多组学数据整合肿瘤分型方法,其特征在于,包括以下步骤:S1、获取肿瘤患者的多组学数据,对多组学数据进行预处理,得到多组学数据集;S2、采用高斯核函数计算每个组学数据集的样本相似核;S3、采用哈达玛积构建不同组学数据集间的交互核;S4、基于每个组学数据集的样本相似核与不同组学数据集间的交互核,采用无监督多核学习构建融合核;S5、在融合核基础上,采用特征值间隙估计最佳分型数;S6、按照最佳分型数,对融合核进行k-means聚类,得到肿瘤分型结果。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 山西医科大学 基于组学-组学核交互的多组学数据整合肿瘤分型方法

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