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药物表观遗传安全性评价的检测分析方法及系统 

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申请/专利权人:广州女娲生命科技有限公司

摘要:本发明实施例涉及表观遗传检测技术领域,公开了一种药物表观遗传安全性评价的检测分析方法,包括:对第一染色体组和第二染色体组进行比对分析以确定用药前后的染色体拷贝数变异;根据设定甲基化测量模型分别计算第一合并测序数据和第二合并测序数据对应的甲基化水平;将得到甲基化差异值以及染色体拷贝数变异来与相应的设定标准比对逻辑进行匹配,若匹配一致,则确定相应药物对表观基因组的影响较小,若匹配不一致,则确定相应药物对表观基因组的影响较大。本发明实施例中药物表观遗传安全性评价的检测分析方法结合了多种表观遗传参数,为药物的安全性评价提供了全面、准确的依据。

主权项:1.一种药物表观遗传安全性评价的检测分析方法,其特征在于,包括:分别对经过数据质量控制之后的第一原始测序数据和第二原始测序数据与预先构建的参考基因组比对,并对比对后的数据进行合并以得到第一合并测序数据和第二合并测序数据;其中,所述第一原始测序数据为用药前细胞组文库对应的测序数据,所述第二原始测序数据为用药后细胞组文库对应的测序数据;分别对所述第一合并测序数据和第二合并测序数据进行TC还原操作以得到第一还原测序数据和第二还原测序数据;并将所述第一还原测序数据和第二还原测序数据与预先构建的参考基因组进行比对以确定测序获得的每条碱基序列在染色体上的第一位置信息和第二位置信息;根据所述第一位置信息将第一合并测序数据进行拼接处理以得到第一染色体组,根据所述第二位置信息将第二合并测序数据进行拼接处理以得到第二染色体组;对所述第一染色体组和第二染色体组进行比对分析以确定用药前后的染色体拷贝数变异;根据设定甲基化测量模型分别计算第一合并测序数据和第二合并测序数据对应的甲基化水平;根据第一合并测序数据和第二合并测序数据对应的甲基化水平来确定甲基化差异值,将得到所述甲基化差异值以及染色体拷贝数变异来与相应的设定标准比对逻辑进行匹配,若匹配一致,则确定相应药物对表观基因组的影响较小,若匹配不一致,则确定相应药物对表观基因组的影响较大。

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