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基于KASP技术开发的杜鹃花核心SNP分子标记集、引物集及应用 

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申请/专利权人:江苏省农业科学院

摘要:本申请公开了基于KASP技术开发的杜鹃花核心SNP分子标记集、引物集及应用,属于分子生物学及植物分子育种技术领域;该杜鹃花核心分子标记集包含31个SNP标记,其对应的KASP扩增引物组核苷酸序列如SEQIDNO.1‑SEQIDNO.93所示;本申请基于KASP技术开发的杜鹃花核心分子标记集,能够快速、准确、有效地鉴定评价杜鹃花的资源或者品种,检测它们的纯度,可以解决因大量种质积累而带来的资源冗余、保存管理不便以及知识产权纠纷等问题,同时可用于杜鹃花SNP指纹图库构建、杜鹃花遗传多样性分析及杜鹃花分子标记辅助育种中。

主权项:1.基于KASP技术开发的杜鹃花核心SNP分子标记集,其特征在于,该杜鹃花核心SNP分子标记集由如下编号为SNP1-SNP31所示的SNP标记组成;所述SNP1标记为碱基CA,位于映山红亚属杜鹃花1号染色体上,位置为映山红亚属杜鹃花全基因组序列的第43229715位;所述SNP2标记为碱基GT,位于映山红亚属杜鹃花1号染色体上,位置为映山红亚属杜鹃花全基因组序列的第46014657位;所述SNP3标记为碱基CA,位于映山红亚属杜鹃花2号染色体上,位置为映山红亚属杜鹃花全基因组序列的第12166301位;所述SNP4标记为碱基AT,位于映山红亚属杜鹃花2号染色体上,位置为映山红亚属杜鹃花全基因组序列的第33907816位;所述SNP5标记为碱基GA,位于映山红亚属杜鹃花2号染色体上,位置为映山红亚属杜鹃花全基因组序列的第34113381位;所述SNP6标记为碱基AG,位于映山红亚属杜鹃花2号染色体上,位置为映山红亚属杜鹃花全基因组序列的第39213730位;所述SNP7标记为碱基CA,位于映山红亚属杜鹃花3号染色体上,位置为映山红亚属杜鹃花全基因组序列的第11204455位;所述SNP8标记为碱基CT,位于映山红亚属杜鹃花3号染色体上,位置为映山红亚属杜鹃花全基因组序列的第12590717位;所述SNP9标记为碱基CT,位于映山红亚属杜鹃花3号染色体上,位置为映山红亚属杜鹃花全基因组序列的第14864773位;所述SNP10标记为碱基TA,位于映山红亚属杜鹃花3号染色体上,位置为映山红亚属杜鹃花全基因组序列的第15859937位;所述SNP11标记为碱基CT,位于映山红亚属杜鹃花3号染色体上,位置为映山红亚属杜鹃花全基因组序列的第20040775位;所述SNP12标记为碱基TC,位于映山红亚属杜鹃花3号染色体上,位置为映山红亚属杜鹃花全基因组序列的第20624365位;所述SNP13标记为碱基AG,位于映山红亚属杜鹃花3号染色体上,位置为映山红亚属杜鹃花全基因组序列的第20637059位;所述SNP14标记为碱基AG,位于映山红亚属杜鹃花3号染色体上,位置为映山红亚属杜鹃花全基因组序列的第23321340位;所述SNP15标记为碱基CT,位于映山红亚属杜鹃花3号染色体上,位置为映山红亚属杜鹃花全基因组序列的第23398629位;所述SNP16标记为碱基TC,位于映山红亚属杜鹃花3号染色体上,位置为映山红亚属杜鹃花全基因组序列的第23933405位;所述SNP17标记为碱基GT,位于映山红亚属杜鹃花3号染色体上,位置为映山红亚属杜鹃花全基因组序列的第36725782位;所述SNP18标记为碱基CT,位于映山红亚属杜鹃花3号染色体上,位置为映山红亚属杜鹃花全基因组序列的第61370位;所述SNP19标记为碱基CG,位于映山红亚属杜鹃花4号染色体上,位置为映山红亚属杜鹃花全基因组序列的第34996743位;所述SNP20标记为碱基TG,位于映山红亚属杜鹃花5号染色体上,位置为映山红亚属杜鹃花全基因组序列的第22571961位;所述SNP21标记为碱基TC,位于映山红亚属杜鹃花5号染色体上,位置为映山红亚属杜鹃花全基因组序列的第27906010位;所述SNP22标记为碱基GT,位于映山红亚属杜鹃花8号染色体上,位置为映山红亚属杜鹃花全基因组序列的第10648788位;所述SNP23标记为碱基TA,位于映山红亚属杜鹃花8号染色体上,位置为映山红亚属杜鹃花全基因组序列的第16412984位;所述SNP24标记为碱基TC,位于映山红亚属杜鹃花8号染色体上,位置为映山红亚属杜鹃花全基因组序列的第18007550位;所述SNP25标记为碱基GA,位于映山红亚属杜鹃花8号染色体上,位置为映山红亚属杜鹃花全基因组序列的第28274862位;所述SNP26标记为碱基GA,位于映山红亚属杜鹃花8号染色体上,位置为映山红亚属杜鹃花全基因组序列的第5119595位;所述SNP27标记为碱基AG,位于映山红亚属杜鹃花9号染色体上,位置为映山红亚属杜鹃花全基因组序列的第12789904位;所述SNP28标记为碱基GT,位于映山红亚属杜鹃花9号染色体上,位置为映山红亚属杜鹃花全基因组序列的第15197698位;所述SNP29标记为碱基GC,位于映山红亚属杜鹃花9号染色体上,位置为映山红亚属杜鹃花全基因组序列的第18195438位;所述SNP30标记为碱基GA,位于映山红亚属杜鹃花11号染色体上,位置为映山红亚属杜鹃花全基因组序列的第26381988位;所述SNP31标记为碱基TA,位于映山红亚属杜鹃花12号染色体上,位置为映山红亚属杜鹃花全基因组序列的第12868899位。

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